BACT000007 (rpsG) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3629
- contig length
- 18216
- start
- 15366
- end
- 15836
- length
- 471
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TGGTCACCCG GCCAAGCTGG TTAGTCGTGA AGATGTGATC GGGTTAGTTG GTGGCCGCGG GGCTGAACAC AGCTCCAACT GAACAGGTAA AGGAAGAATC ATGCCGCGTC GTCGCGAAGT CCCCAAGCGG GAAGTGTTGC CGGATCCGAA GTACGGCAAC GTGGATGTAG CCAAGTTCAT GAACATGCTG ATGCTGTCCG GCAAGAAGTC GGTCGCTGAA CGCATCGTTT ATGGTGCTTT CGAACAGATC CAGACCAAGG GTGGCAAGGA CCCGCTGGAA GTGTTCACGG TTGCGCTCAA CAACGTCAAG CCGGTGGTCG AAGTGAAGAG CCGCCGCGTT GGTGGTGCCA ACTATCAAGT TCCGGTCGAA GTGCGCCCGT CGCGTCGTAT GGCATTGGCG ATGCGCTGGC TGCGTGAGGC TGCGAAGAAG CGCAGCGAGA AGTCGATGGC TCTGCGCCTG GCAGGTGAAC TCTCCGAGGC GGCCGAAGGC CGTGGCGGCG CGATGAAGAA GCGCGACGAA GTTCACCGCA TGGCAGAAGC CAACCGCGCG TTCTCGCATT TCCGTTTCTA AGCGCCTGGC TGGGCTGTTA GCGGAAATAA ATTCCGGGCG GGTGCGCTTT TCGAGCGCCT CGCCCGTTTG TGTTGAGGCG CGATGCAGCA GGGCTGCGTC G
Translation
W S P G Q A G * S * R C D R V S W W P R G * T Q L Q L N R * R K N H F1
G H P A K L V S R E D V I G L V G G R G A E H S S N * T G K G R I F2
V T R P S W L V V K M * S G * L V A A G L N T A P T E Q V K E E S F3
1 TGGTCACCCGGCCAAGCTGGTTAGTCGTGAAGATGTGATCGGGTTAGTTGGTGGCCGCGGGGCTGAACACAGCTCCAACTGAACAGGTAAAGGAAGAATC 100
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A A S S R S P Q A G S V A G S E V R Q R G C S Q V H E H A D A V R F1
M P R R R E V P K R E V L P D P K Y G N V D V A K F M N M L M L S G F2
C R V V A K S P S G K C C R I R S T A T W M * P S S * T C * C C P F3
101 ATGCCGCGTCGTCGCGAAGTCCCCAAGCGGGAAGTGTTGCCGGATCCGAAGTACGGCAACGTGGATGTAGCCAAGTTCATGAACATGCTGATGCTGTCCG 200
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Q E V G R * T H R L W C F R T D P D Q G W Q G P A G S V H G C A Q F1
K K S V A E R I V Y G A F E Q I Q T K G G K D P L E V F T V A L N F2
A R S R S L N A S F M V L S N R S R P R V A R T R W K C S R L R S T F3
201 GCAAGAAGTCGGTCGCTGAACGCATCGTTTATGGTGCTTTCGAACAGATCCAGACCAAGGGTGGCAAGGACCCGCTGGAAGTGTTCACGGTTGCGCTCAA 300
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Q R Q A G G R S E E P P R W W C Q L S S S G R S A P V A S Y G I G D F1
N V K P V V E V K S R R V G G A N Y Q V P V E V R P S R R M A L A F2
T S S R W S K * R A A A L V V P T I K F R S K C A R R V V W H W R F3
301 CAACGTCAAGCCGGTGGTCGAAGTGAAGAGCCGCCGCGTTGGTGGTGCCAACTATCAAGTTCCGGTCGAAGTGCGCCCGTCGCGTCGTATGGCATTGGCG 400
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A L A A * G C E E A Q R E V D G S A P G R * T L R G G R R P W R R F1
M R W L R E A A K K R S E K S M A L R L A G E L S E A A E G R G G A F2
C A G C V R L R R S A A R S R W L C A W Q V N S P R R P K A V A A F3
401 ATGCGCTGGCTGCGTGAGGCTGCGAAGAAGCGCAGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGCCTGGCAGGTGAACTCTCCGAGGCGGCCGAAGGCCGTGGCGGCG 500
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D E E A R R S S P H G R S Q P R V L A F P F L S A W L G C * R K * F1
M K K R D E V H R M A E A N R A F S H F R F * A P G W A V S G N K F2
R * R S A T K F T A W Q K P T A R S R I S V S K R L A G L L A E I N F3
501 CGATGAAGAAGCGCGACGAAGTTCACCGCATGGCAGAAGCCAACCGCGCGTTCTCGCATTTCCGTTTCTAAGCGCCTGGCTGGGCTGTTAGCGGAAATAA 600
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I P G G C A F R A P R P F V L R R D A A G L R R F1
F R A G A L F E R L A R L C * G A M Q Q G C V X F2
S G R V R F S S A S P V C V E A R C S R A A S F3
601 ATTCCGGGCGGGTGCGCTTTTCGAGCGCCTCGCCCGTTTGTGTTGAGGCGCGATGCAGCAGGGCTGCGTCG 671
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