BACT000006 (rpsF) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3670
- contig length
- 229761
- start
- 90641
- end
- 91015
- length
- 375
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGGCATTGCA CACGGCGCGT ATCCGGGTTA GAATCTTCGG CTTCTCACTT GCCACACCGG TTCAGACGCC CGGGTGGCTT CTATCCACAA GGAGTGTGTA ATGCGTCATT ACGAAATCGT CTTCATCGTG CACCCCGATC AGAGCGAGCA AGTGCCCGCG ATGATCGAGC GTTACAAGAC CACGATCACC TCGCACGGCG GCCAGATCCA CCGTGTCGAA GACTGGGGCC GTCGCCAGCT GGCCTACATG ATCGAGAAAC TCGCGAAGGC TCACTACGTC TGCATGAACA TCGAGTGCGA CCAGACGACG CTCGATGAAC TCGAACACGC GTTCAAGTTC AACGACGCCG TGCTGCGTCA CCTCATCGTC AAGATGAAGA AGGCCGAAAC CGGCCCGTCG CCGATGATGA AGGAAGTTCA GCGCGAAGAA GCCAAGAAGG CGGCTGCCGC TCAGCCGACC GAAGCGCAGG CTTAAGCTCG TCTCGATTAA GCCACCAAGG AGCACGCCAC TCACGTGAAC AGGTTGCAAT TGACGGCAAG CGTCGTCGAG CGCGCAGCGG TGCGATACAC GCCCG
Translation
R H C T R R V S G L E S S A S H L P H R F R R P G G F Y P Q G V C N F1
G I A H G A Y P G * N L R L L T C H T G S D A R V A S I H K E C V F2
A L H T A R I R V R I F G F S L A T P V Q T P G W L L S T R S V * F3
1 CGGCATTGCACACGGCGCGTATCCGGGTTAGAATCTTCGGCTTCTCACTTGCCACACCGGTTCAGACGCCCGGGTGGCTTCTATCCACAAGGAGTGTGTA 100
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A S L R N R L H R A P R S E R A S A R D D R A L Q D H D H L A R R F1
M R H Y E I V F I V H P D Q S E Q V P A M I E R Y K T T I T S H G G F2
C V I T K S S S S C T P I R A S K C P R * S S V T R P R S P R T A F3
101 ATGCGTCATTACGAAATCGTCTTCATCGTGCACCCCGATCAGAGCGAGCAAGTGCCCGCGATGATCGAGCGTTACAAGACCACGATCACCTCGCACGGCG 200
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P D P P C R R L G P S P A G L H D R E T R E G S L R L H E H R V R F1
Q I H R V E D W G R R Q L A Y M I E K L A K A H Y V C M N I E C D F2
A R S T V S K T G A V A S W P T * S R N S R R L T T S A * T S S A T F3
201 GCCAGATCCACCGTGTCGAAGACTGGGGCCGTCGCCAGCTGGCCTACATGATCGAGAAACTCGCGAAGGCTCACTACGTCTGCATGAACATCGAGTGCGA 300
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P D D A R * T R T R V Q V Q R R R A A S P H R Q D E E G R N R P V A F1
Q T T L D E L E H A F K F N D A V L R H L I V K M K K A E T G P S F2
R R R S M N S N T R S S S T T P C C V T S S S R * R R P K P A R R F3
301 CCAGACGACGCTCGATGAACTCGAACACGCGTTCAAGTTCAACGACGCCGTGCTGCGTCACCTCATCGTCAAGATGAAGAAGGCCGAAACCGGCCCGTCG 400
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D D E G S S A R R S Q E G G C R S A D R S A G L S S S R L S H Q G F1
P M M K E V Q R E E A K K A A A A Q P T E A Q A * A R L D * A T K E F2
R * * R K F S A K K P R R R L P L S R P K R R L K L V S I K P P R F3
401 CCGATGATGAAGGAAGTTCAGCGCGAAGAAGCCAAGAAGGCGGCTGCCGCTCAGCCGACCGAAGCGCAGGCTTAAGCTCGTCTCGATTAAGCCACCAAGG 500
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A R H S R E Q V A I D G K R R R A R S G A I H A R F1
H A T H V N R L Q L T A S V V E R A A V R Y T P X F2
S T P L T * T G C N * R Q A S S S A Q R C D T R P F3
501 AGCACGCCACTCACGTGAACAGGTTGCAATTGACGGCAAGCGTCGTCGAGCGCGCAGCGGTGCGATACACGCCCG 575
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