tkt allele sequence: id-1015

Contig position

sequence bin id
86
contig length
342238
start
6374
end
6835
length
462
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

AAGTAAACAT TTAAATGTAA ATCCAGCTGA TGAAAAATGG TTAAATAGAG ATAGATTAGT ATTTTCAGGT GGTCATGCAA CTGGATTAGT TTACTCTTTA TTACATCTTT GGGGATTTAA TGTATCTATA AATGATATTA AAAACTTTAG ACAAACTCAC TCTAAAACTC CAGGACATCC AGAATATGGT CATACTCATG GAATTGAAAT TACAACAGGA CCTTTAGGAC AAGGAATTGC AAATGCAGTT GGATTTGCAA TGGCAGGAAA ATATGCACAA AATCTTCTTG GAAGTGATGT AATCAATCAT AAAGTTTACT GTTTATGTGG TGATGGAGAT TTACAAGAGG GTATTTCTTA TGAAGCAACA GCAACAGCAG GACATTTAAA ACTTGATAAT CTTGTAATAA TTTATGATTC AAATTCAATC ACAATTGAAG GTGATACAAG TATTTCTTGG AGTGAAAATG TTAAAAAAAG ATTTCAAGCT ATTGATTTTG AAGTAATAGA AATAGATGGA CATAATTTTG ATCAAATTGA TAAAGCTTTA GTTGCAGCTA AATCATCAAC TCTTCCAGTA TTAATTATTG CAAAAACAGC AATTGCAAAA GGTGCAGTAA CAATGGAAGG AAGCCACCAT TCTCATGGAG CACCGTTAGG TG

Translation


          K  *  T  F  K  C  K  S  S  *  *  K  M  V  K  *  R  *  I  S  I  F  R  W  S  C  N  W  I  S  L  L  F  I   F1
           S  K  H  L  N  V  N  P  A  D  E  K  W  L  N  R  D  R  L  V  F  S  G  G  H  A  T  G  L  V  Y  S  L     F2
            V  N  I  *  M  *  I  Q  L  M  K  N  G  *  I  E  I  D  *  Y  F  Q  V  V  M  Q  L  D  *  F  T  L  Y    F3
        1 AAGTAAACATTTAAATGTAAATCCAGCTGATGAAAAATGGTTAAATAGAGATAGATTAGTATTTTCAGGTGGTCATGCAACTGGATTAGTTTACTCTTTA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            T  S  L  G  I  *  C  I  Y  K  *  Y  *  K  L  *  T  N  S  L  *  N  S  R  T  S  R  I  W  S  Y  S  W    F1
          L  H  L  W  G  F  N  V  S  I  N  D  I  K  N  F  R  Q  T  H  S  K  T  P  G  H  P  E  Y  G  H  T  H  G   F2
           Y  I  F  G  D  L  M  Y  L  *  M  I  L  K  T  L  D  K  L  T  L  K  L  Q  D  I  Q  N  M  V  I  L  M     F3
      101 TTACATCTTTGGGGATTTAATGTATCTATAAATGATATTAAAAACTTTAGACAAACTCACTCTAAAACTCCAGGACATCCAGAATATGGTCATACTCATG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           N  *  N  Y  N  R  T  F  R  T  R  N  C  K  C  S  W  I  C  N  G  R  K  I  C  T  K  S  S  W  K  *  C     F1
            I  E  I  T  T  G  P  L  G  Q  G  I  A  N  A  V  G  F  A  M  A  G  K  Y  A  Q  N  L  L  G  S  D  V    F2
          E  L  K  L  Q  Q  D  L  *  D  K  E  L  Q  M  Q  L  D  L  Q  W  Q  E  N  M  H  K  I  F  L  E  V  M  *   F3
      201 GAATTGAAATTACAACAGGACCTTTAGGACAAGGAATTGCAAATGCAGTTGGATTTGCAATGGCAGGAAAATATGCACAAAATCTTCTTGGAAGTGATGT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          N  Q  S  *  S  L  L  F  M  W  *  W  R  F  T  R  G  Y  F  L  *  S  N  S  N  S  R  T  F  K  T  *  *  S   F1
           I  N  H  K  V  Y  C  L  C  G  D  G  D  L  Q  E  G  I  S  Y  E  A  T  A  T  A  G  H  L  K  L  D  N     F2
            S  I  I  K  F  T  V  Y  V  V  M  E  I  Y  K  R  V  F  L  M  K  Q  Q  Q  Q  Q  D  I  *  N  L  I  I    F3
      301 AATCAATCATAAAGTTTACTGTTTATGTGGTGATGGAGATTTACAAGAGGGTATTTCTTATGAAGCAACAGCAACAGCAGGACATTTAAAACTTGATAAT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            C  N  N  L  *  F  K  F  N  H  N  *  R  *  Y  K  Y  F  L  E  *  K  C  *  K  K  I  S  S  Y  *  F  *    F1
          L  V  I  I  Y  D  S  N  S  I  T  I  E  G  D  T  S  I  S  W  S  E  N  V  K  K  R  F  Q  A  I  D  F  E   F2
           L  *  *  F  M  I  Q  I  Q  S  Q  L  K  V  I  Q  V  F  L  G  V  K  M  L  K  K  D  F  K  L  L  I  L     F3
      401 CTTGTAATAATTTATGATTCAAATTCAATCACAATTGAAGGTGATACAAGTATTTCTTGGAGTGAAAATGTTAAAAAAAGATTTCAAGCTATTGATTTTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           S  N  R  N  R  W  T  *  F  *  S  N  *  *  S  F  S  C  S  *  I  I  N  S  S  S  I  N  Y  C  K  N  S     F1
            V  I  E  I  D  G  H  N  F  D  Q  I  D  K  A  L  V  A  A  K  S  S  T  L  P  V  L  I  I  A  K  T  A    F2
          K  *  *  K  *  M  D  I  I  L  I  K  L  I  K  L  *  L  Q  L  N  H  Q  L  F  Q  Y  *  L  L  Q  K  Q  Q   F3
      501 AAGTAATAGAAATAGATGGACATAATTTTGATCAAATTGATAAAGCTTTAGTTGCAGCTAAATCATCAACTCTTCCAGTATTAATTATTGCAAAAACAGC 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          N  C  K  R  C  S  N  N  G  R  K  P  P  F  S  W  S  T  V  R  X                                          F1
           I  A  K  G  A  V  T  M  E  G  S  H  H  S  H  G  A  P  L  G  X                                         F2
            L  Q  K  V  Q  *  Q  W  K  E  A  T  I  L  M  E  H  R  *  V                                           F3
      601 AATTGCAAAAGGTGCAGTAACAATGGAAGGAAGCCACCATTCTCATGGAGCACCGTTAGGTG 662
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|--