glyA allele sequence: id-1015
Contig position
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- Illumina
Sequence
TGCAAATGTT CAACCACACT CAGGAAGCCA AGCTAATGGA GCAGTATATG CAGCATTAAT AAAAGCTGGT GATAAAATCT TAGGTATGGA TTTATCTCAT GGTGGACATT TAACTCATGG TTCTAAACCA TCATTTTCTG GACAAAATTA TCAAGCATTC TATTATGGAG TTGAACTTGA TGGAAGAATT AATTATGATA AAGTTGAAGA GATAGCAAAA ATAGTTCAAC CAAAAATAAT CGTTTGTGGT GCTTCTGCAT ACGCAAGAGA AATTGACTTC AAAAGATTTA GAGAAATAGC AGATTCAGTT GGAGCTATTT TATTTGCAGA TATTGCACAT ATTGCAGGTC TTGTAGCAGC TAATGAACAT CCAAGCCCAT TTCCTCATGC ACATATAGTT ACAACTACTA CTCATAAGAC TTTAAGAGGT CCAAGAGGTG GTATGATAAT GACAAATGAT GAAGAAATAG CTAAAAAAAT AAACTCAGCT ATTTTCCCAG GACTTCAAGG TGGACCACTT GTTCATGTAA TAGCAGCAAA AGCAGTAGCA TTTAAAGAGA TACTTGATCC AAAATGGAAA GATTATGCAA AACAAGTAAA AGCAAATGCA AAAGTGTTAG GAGAAGTTCT AACAAAAAGA GGATATGATA TAGTAAGTGG TGGAACAGAT AATCACTTAG TATTAGTAAG TTTTTTAAAT AAACCAT
Translation
C K C S T T L R K P S * W S S I C S I N K S W * * N L R Y G F I S W F1
A N V Q P H S G S Q A N G A V Y A A L I K A G D K I L G M D L S H F2
Q M F N H T Q E A K L M E Q Y M Q H * * K L V I K S * V W I Y L M F3
1 TGCAAATGTTCAACCACACTCAGGAAGCCAAGCTAATGGAGCAGTATATGCAGCATTAATAAAAGCTGGTGATAAAATCTTAGGTATGGATTTATCTCAT 100
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W T F N S W F * T I I F W T K L S S I L L W S * T * W K N * L * * F1
G G H L T H G S K P S F S G Q N Y Q A F Y Y G V E L D G R I N Y D K F2
V D I * L M V L N H H F L D K I I K H S I M E L N L M E E L I M I F3
101 GGTGGACATTTAACTCATGGTTCTAAACCATCATTTTCTGGACAAAATTATCAAGCATTCTATTATGGAGTTGAACTTGATGGAAGAATTAATTATGATA 200
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S * R D S K N S S T K N N R L W C F C I R K R N * L Q K I * R N S F1
V E E I A K I V Q P K I I V C G A S A Y A R E I D F K R F R E I A F2
K L K R * Q K * F N Q K * S F V V L L H T Q E K L T S K D L E K * Q F3
201 AAGTTGAAGAGATAGCAAAAATAGTTCAACCAAAAATAATCGTTTGTGGTGCTTCTGCATACGCAAGAGAAATTGACTTCAAAAGATTTAGAGAAATAGC 300
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R F S W S Y F I C R Y C T Y C R S C S S * * T S K P I S S C T Y S Y F1
D S V G A I L F A D I A H I A G L V A A N E H P S P F P H A H I V F2
I Q L E L F Y L Q I L H I L Q V L * Q L M N I Q A H F L M H I * L F3
301 AGATTCAGTTGGAGCTATTTTATTTGCAGATATTGCACATATTGCAGGTCTTGTAGCAGCTAATGAACATCCAAGCCCATTTCCTCATGCACATATAGTT 400
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N Y Y S * D F K R S K R W Y D N D K * * R N S * K N K L S Y F P R F1
T T T T H K T L R G P R G G M I M T N D E E I A K K I N S A I F P G F2
Q L L L I R L * E V Q E V V * * * Q M M K K * L K K * T Q L F S Q F3
401 ACAACTACTACTCATAAGACTTTAAGAGGTCCAAGAGGTGGTATGATAATGACAAATGATGAAGAAATAGCTAAAAAAATAAACTCAGCTATTTTCCCAG 500
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T S R W T T C S C N S S K S S S I * R D T * S K M E R L C K T S K F1
L Q G G P L V H V I A A K A V A F K E I L D P K W K D Y A K Q V K F2
D F K V D H L F M * * Q Q K Q * H L K R Y L I Q N G K I M Q N K * K F3
501 GACTTCAAGGTGGACCACTTGTTCATGTAATAGCAGCAAAAGCAGTAGCATTTAAAGAGATACTTGATCCAAAATGGAAAGATTATGCAAAACAAGTAAA 600
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S K C K S V R R S S N K K R I * Y S K W W N R * S L S I S K F F K * F1
A N A K V L G E V L T K R G Y D I V S G G T D N H L V L V S F L N F2
Q M Q K C * E K F * Q K E D M I * * V V E Q I I T * Y * * V F * I F3
601 AGCAAATGCAAAAGTGTTAGGAGAAGTTCTAACAAAAAGAGGATATGATATAGTAAGTGGTGGAACAGATAATCACTTAGTATTAGTAAGTTTTTTAAAT 700
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T X F1
K P X F2
N H F3
701 AAACCAT 707
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