glnA allele sequence: id-1015

Contig position

sequence bin id
81
contig length
69284
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8400
end
8873
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474
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

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Translation


          R  *  W  N  A  F  *  W  F  V  N  *  C  L  A  T  N  S  Q  I  R  Y  G  V  K  T  R  C  W  Y  C  V  F  R   F1
           D  N  G  M  P  F  D  G  S  S  I  D  A  W  Q  P  I  H  R  S  D  M  V  L  K  P  D  V  G  T  A  F  L     F2
            I  M  E  C  L  L  M  V  R  Q  L  M  L  G  N  Q  F  T  D  Q  I  W  C  *  N  Q  M  L  V  L  R  F  *    F3
        1 AGATAATGGAATGCCTTTTGATGGTTCGTCAATTGATGCTTGGCAACCAATTCACAGATCAGATATGGTGTTAAAACCAGATGTTGGTACTGCGTTTTTA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            S  I  Y  C  R  F  N  N  H  C  N  L  *  C  L  *  Y  L  *  R  T  N  V  *  K  M  S  *  I  Y  C  *  K    F1
          D  P  F  T  A  D  S  T  I  I  V  I  C  D  V  Y  D  I  Y  K  G  Q  M  Y  E  K  C  P  R  S  I  A  K  K   F2
           I  H  L  L  Q  I  Q  Q  S  L  *  F  V  M  F  M  I  F  I  K  D  K  C  M  K  N  V  L  D  L  L  L  K     F3
      101 GATCCATTTACTGCAGATTCAACAATCATTGTAATTTGTGATGTTTATGATATTTATAAAGGACAAATGTATGAAAAATGTCCTAGATCTATTGCTAAAA 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           N  F  R  L  F  S  A  I  R  C  W  *  C  C  I  F  W  T  R  K  *  V  F  C  I  *  R  C  K  N  K  R  Y     F1
            T  L  D  Y  L  A  Q  S  G  A  G  D  V  A  Y  F  G  P  E  N  E  F  F  V  F  E  D  V  R  I  K  D  T    F2
          K  L  *  I  I  *  R  N  Q  V  L  V  M  L  H  I  L  D  Q  K  M  S  F  L  Y  L  K  M  *  E  *  K  I  Q   F3
      201 AAACTTTAGATTATTTAGCGCAATCAGGTGCTGGTGATGTTGCATATTTTGGACCAGAAAATGAGTTTTTTGTATTTGAAGATGTAAGAATAAAAGATAC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          N  Q  *  I  I  L  *  S  *  *  R  R  W  *  M  E  *  F  N  R  L  R  R  W  K  C  W  T  *  T  K  S  K  R   F1
           I  N  E  S  Y  Y  K  V  D  S  E  D  G  E  W  N  D  S  T  D  Y  E  G  G  N  V  G  H  R  P  R  V  K     F2
            S  M  N  H  I  I  K  L  I  A  K  M  V  N  G  M  I  Q  Q  I  T  K  V  E  M  L  D  I  D  Q  E  *  K    F3
      301 AATCAATGAATCATATTATAAAGTTGATAGCGAAGATGGTGAATGGAATGATTCAACAGATTACGAAGGTGGAAATGTTGGACATAGACCAAGAGTAAAA 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            W  I  F  P  C  S  S  N  *  Y  R  S  *  F  K  S  *  N  D  A  S  F  R  A  S  W  F  R  S  C  F  R  T    F1
          G  G  Y  F  P  V  A  P  I  D  T  G  V  D  L  R  A  E  M  M  Q  V  L  E  Q  V  G  L  E  V  V  L  G  H   F2
           V  D  I  S  L  *  L  Q  L  I  Q  E  L  I  *  E  L  K  *  C  K  F  *  S  K  L  V  *  K  L  F  *  D     F3
      401 GGTGGATATTTCCCTGTAGCTCCAATTGATACAGGAGTTGATTTAAGAGCTGAAATGATGCAAGTTTTAGAGCAAGTTGGTTTAGAAGTTGTTTTAGGAC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           P  R  S  C  S  R  T  T  R  N  W  Y  C  I  R  R  F  N  *  S  F  *  *  R  T  K  I  K  I  C  N  *  N     F1
            H  E  V  A  Q  G  Q  H  E  I  G  I  V  F  G  D  L  I  E  A  S  D  N  V  Q  K  L  K  Y  V  I  K  M    F2
          T  T  K  L  L  K  D  N  T  K  L  V  L  Y  S  E  I  *  L  K  L  L  I  T  Y  K  N  *  N  M  *  L  K  W   F3
      501 ACCACGAAGTTGCTCAAGGACAACACGAAATTGGTATTGTATTCGGAGATTTAATTGAAGCTTCTGATAACGTACAAAAATTAAAATATGTAATTAAAAT 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  C  S  L  K  W  *  I  S  N  I  Y  A  K  T  T  L  W  *  *  W  K  W  N  A                              F1
           V  A  H  L  N  G  K  S  A  T  F  M  P  K  P  L  Y  G  D  N  G  N  G  M  X                             F2
            L  L  T  *  M  V  N  Q  Q  H  L  C  Q  N  H  F  M  V  I  M  E  M  E  C                               F3
      601 GGTTGCTCACTTAAATGGTAAATCAGCAACATTTATGCCAAAACCACTTTATGGTGATAATGGAAATGGAATGC 674
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