atpA allele sequence: id-1015

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method
Illumina
Options

Sequence

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Translation


          L  Y  L  C  C  N  W  T  K  I  I  F  Y  C  F  C  C  *  N  I  R  R  I  R  C  Y  G  L  Y  N  C  C  K  C   F1
           C  I  Y  V  A  I  G  Q  K  S  S  S  I  A  S  V  V  R  T  L  E  E  S  G  A  M  D  Y  T  I  V  V  N     F2
            V  F  M  L  Q  L  D  K  N  H  L  L  L  L  L  L  L  E  H  *  K  N  Q  V  L  W  I  I  Q  L  L  *  M    F3
        1 TTGTATTTATGTTGCAATTGGACAAAAATCATCTTCTATTGCTTCTGTTGTTAGAACATTAGAAGAATCAGGTGCTATGGATTATACAATTGTTGTAAAT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            I  S  C  *  F  I  C  F  T  I  L  S  S  I  Y  W  C  Y  N  W  *  V  L  *  R  *  W  K  T  C  I  N  Y    F1
          A  S  A  A  D  S  S  A  L  Q  F  L  A  P  Y  T  G  V  T  I  G  E  Y  F  R  D  N  G  K  H  A  L  I  I   F2
           H  Q  L  L  I  H  L  L  Y  N  S  *  L  H  I  L  V  L  Q  L  V  S  T  L  E  I  M  E  N  M  H  *  L     F3
      101 GCATCAGCTGCTGATTCATCTGCTTTACAATTCTTAGCTCCATATACTGGTGTTACAATTGGTGAGTACTTTAGAGATAATGGAAAACATGCATTAATTA 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           L  *  *  F  I  *  T  C  C  C  I  *  R  N  V  I  N  F  K  K  T  S  R  K  R  S  I  P  R  G  C  I  L     F1
            Y  D  D  L  S  K  H  A  V  A  Y  R  E  M  S  L  I  L  R  R  P  P  G  R  E  A  Y  P  G  D  V  F  Y    F2
          F  M  M  I  Y  L  N  M  L  L  H  I  E  K  C  H  *  F  *  E  D  L  Q  E  E  K  H  T  Q  G  M  Y  S  I   F3
      201 TTTATGATGATTTATCTAAACATGCTGTTGCATATAGAGAAATGTCATTAATTTTAAGAAGACCTCCAGGAAGAGAAGCATACCCAGGGGATGTATTCTA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  T  L  K  I  I  R  K  S  C  K  N  V  R  *  K  R  C  W  I  N  D  S  F  T  N  H  R  N  T  S  W  R  R   F1
           L  H  S  R  L  L  E  R  A  A  K  M  S  D  E  R  G  A  G  S  M  T  A  L  P  I  I  E  T  Q  A  G  D     F2
            Y  T  Q  D  Y  *  K  E  L  Q  K  C  Q  M  K  E  V  L  D  Q  *  Q  L  Y  Q  S  S  K  H  K  L  E  T    F3
      301 TCTACACTCAAGATTATTAGAAAGAGCTGCAAAAATGTCAGATGAAAGAGGTGCTGGATCAATGACAGCTTTACCAATCATCGAAACACAAGCTGGAGAC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            C  C  I  Y  S  N  K  C  N  F  Y  Y  *  W  T  N  L  L  R  N  *  P  I  *  L  R  Y  *  T  C  N  *  R    F1
          V  A  A  Y  I  P  T  N  V  I  S  I  T  D  G  Q  I  F  L  E  T  N  L  F  N  S  G  I  R  P  A  I  N  V   F2
           L  L  H  I  F  Q  Q  M  *  F  L  L  L  M  D  K  S  S  *  K  L  T  Y  L  T  Q  V  L  D  L  Q  L  T     F3
      401 GTTGCTGCATATATTCCAACAAATGTAATTTCTATTACTGATGGACAAATCTTCTTAGAAACTAACCTATTTAACTCAGGTATTAGACCTGCAATTAACG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           W  F  I  S  I  K  S  W  W  S  C  T  N  *  S  Y  K  T  S  C  W  Y  F  K  I  I  F  S  A  I  *  R  T     F1
            G  L  S  V  S  R  V  G  G  A  A  Q  I  K  A  T  K  Q  V  A  G  T  L  K  L  S  L  A  Q  Y  R  E  L    F2
          L  V  Y  Q  Y  Q  E  L  V  E  L  H  K  L  K  L  Q  N  K  L  L  V  L  *  N  Y  L  *  R  N  I  E  N  L   F3
      501 TTGGTTTATCAGTATCAAGAGTTGGTGGAGCTGCACAAATTAAAGCTACAAAACAAGTTGCTGGTACTTTAAAATTATCTTTAGCGCAATATAGAGAACT 600
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          *  S  V  C  S  I  C  I  R  F  R  *  S  N  K  K  R  V  R  T  W  T  K  N  G  *  S  F  K  T               F1
           E  A  F  A  Q  F  A  S  D  L  D  E  A  T  R  R  E  L  E  L  G  Q  R  M  V  E  V  L  K  X              F2
            K  R  L  L  N  L  H  Q  I  *  M  K  Q  Q  E  E  S  *  N  L  D  K  E  W  L  K  F  *  N                F3
      601 TGAAGCGTTTGCTCAATTTGCATCAGATTTAGATGAAGCAACAAGAAGAGAGTTAGAACTTGGACAAAGAATGGTTGAAGTTTTAAAAC 689
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