aspA allele sequence: id-1015

Contig position

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113
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103401
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forward
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yes
method
Illumina
Options

Sequence

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Translation


          *  S  S  R  V  *  R  Y  F  K  N  G  K  N  S  T  S  R  C  C  S  Y  D  F  R  S  R  V  *  N  L  C  N  N   F1
           K  A  V  E  F  K  D  I  L  K  M  G  R  T  Q  L  Q  D  A  V  P  M  T  L  G  Q  E  F  K  T  Y  A  T     F2
            K  Q  *  S  L  K  I  F  *  K  W  E  E  L  N  F  K  M  L  F  L  *  L  *  V  K  S  L  K  L  M  Q  Q    F3
        1 TAAAGCAGTAGAGTTTAAAGATATTTTAAAAATGGGAAGAACTCAACTTCAAGATGCTGTTCCTATGACTTTAGGTCAAGAGTTTAAAACTTATGCAACA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  R  *  *  Y  F  *  T  V  K  S  T  R  Y  A  K  R  G  K  S  R  S  N  S  Y  W  N  W  Y  *  Y  K  T    F1
          M  I  D  D  D  I  F  R  L  S  R  A  Q  D  M  L  K  E  V  N  L  G  A  T  A  I  G  T  G  I  N  T  K  P   F2
           *  *  M  M  I  F  L  D  C  Q  E  H  K  I  C  *  K  R  *  I  *  E  Q  Q  L  L  E  L  V  L  I  Q  N     F3
      101 ATGATAGATGATGATATTTTTAGACTGTCAAGAGCACAAGATATGCTAAAAGAGGTAAATCTAGGAGCAACAGCTATTGGAACTGGTATTAATACAAAAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  I  S  R  I  S  Y  K  K  L  T  N  S  Y  R  S  *  I  L  *  S  K  *  Y  D  R  S  Y  S  R  Y  G  F     F1
            E  Y  Q  E  L  V  I  K  N  L  R  I  V  T  G  A  E  Y  Y  K  A  N  D  M  I  E  A  T  Q  D  T  G  S    F2
          Q  N  I  K  N  *  L  *  K  T  Y  E  *  L  Q  E  L  N  T  I  K  Q  M  I  *  *  K  L  L  K  I  R  V  L   F3
      201 CAGAATATCAAGAATTAGTTATAAAAAACTTACGAATAGTTACAGGAGCTGAATACTATAAAGCAAATGATATGATAGAAGCTACTCAAGATACGGGTTC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          F  C  T  N  F  W  K  I  *  I  Y  C  N  K  S  F  K  N  L  *  *  F  K  T  F  K  F  R  S  K  S  W  I  K   F1
           F  V  Q  I  S  G  R  F  K  S  I  A  I  K  V  S  K  I  C  N  D  L  R  L  L  S  S  G  P  R  A  G  L     F2
            L  Y  K  F  L  E  D  L  N  L  L  Q  *  K  F  Q  K  F  V  M  I  *  D  F  *  V  Q  V  Q  E  L  D  *    F3
      301 TTTTGTACAAATTTCTGGAAGATTTAAATCTATTGCAATAAAAGTTTCAAAAATTTGTAATGATTTAAGACTTTTAAGTTCAGGTCCAAGAGCTGGATTA 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            *  D  K  S  S  S  N  A  T  W  K  F  N  N  A  R  K  S  K  S  S  Y  A  R  S  C  K  S  S  C  F  *  S    F1
          N  E  I  N  L  P  P  M  Q  P  G  S  S  I  M  P  G  K  V  N  P  V  M  P  E  V  V  N  Q  V  A  F  E  V   F2
           M  R  *  I  F  L  Q  C  N  L  E  V  Q  *  C  Q  E  K  *  I  Q  L  C  Q  K  L  *  I  K  L  L  L  K     F3
      401 AATGAGATAAATCTTCCTCCAATGCAACCTGGAAGTTCAATAATGCCAGGAAAAGTAAATCCAGTTATGCCAGAAGTTGTAAATCAAGTTGCTTTTGAAG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           N  W  C  R  Y  N  Y  R  N  S  *  *  T  R  T  T  S  T  K  C  F  *  T  N  N  C  I  *  I  I  Y  F  Y     F1
            I  G  A  D  T  T  I  A  I  A  S  E  H  G  Q  L  Q  L  N  V  F  E  P  I  I  A  Y  K  L  F  I  S  I    F2
          *  L  V  Q  I  Q  L  S  Q  *  L  V  N  T  D  N  F  N  *  M  F  L  N  Q  *  L  H  I  N  Y  L  F  L  *   F3
      501 TAATTGGTGCAGATACAACTATCGCAATAGCTAGTGAACACGGACAACTTCAACTAAATGTTTTTGAACCAATAATTGCATATAAATTATTTATTTCTAT 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          K  H  D  E  K  S  I  *  K  F  S  *  K  M  Y  Q  R  N  Y  C  K  S  *  D  L  X                           F1
           N  M  M  R  R  A  F  E  S  L  A  E  K  C  I  K  G  I  T  A  N  P  E  I  C  X                          F2
            T  *  *  E  E  H  L  K  V  *  L  K  N  V  S  K  E  L  L  Q  I  L  R  F  V                            F3
      601 AAACATGATGAGAAGAGCATTTGAAAGTTTAGCTGAAAAATGTATCAAAGGAATTACTGCAAATCCTGAGATTTGTA 677
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