tkt allele sequence: id-1014

Contig position

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5
contig length
271307
start
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end
262718
length
462
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

AAGTAAACAT TTAAATGTAA ATCCAGCTGA TGAAAAATGG CTAAATAGAG ATAGATTAGT ATTTTCAGGT GGTCATGCAA CTGGATTAGT TTACTCTTTA TTACATCTTT GGGGATTTAA TGTATCTATA AATGATATTA AAAACTTTAG ACAAACTCAC TCTAAAACTC CAGGACATCC AGAATATGGT CATACTCATG GAATTGAAAT TACAACAGGA CCTTTAGGAC AAGGAATTGC AAATGCAGTT GGATTTGCAA TGGCAGGAAA ATATGCACAA AATCTTCTTG GAAGTGATGT AATCAATCAT AAAGTTTACT GTTTATGTGG TGATGGAGAC TTACAAGAAG GTATTTCTTA TGAAGCAACA GCAACAGCAG GACATTTAAA ACTTGATAAT CTTGTGATAA TTTATGATTC AAATTCAATC ACAATTGAAG GTGATACAAG TATTTCTTGG AGTGAAAATG TTAAAAAAAG ATTTCAAGCT ATTGATTTTG AAGTAATAGA AATTGATGGA CATAATTTTG ATCAAATTGA TAAAGCTTTA GTTGCAGCTA AATCATCAAC TCTTCCAGTA TTAATTATTG CAAAAACAGC AATTGCAAAA GGTGCAGTAA CAATGGAAGG AAGCCACCAT TCTCATGGAG CACCGTTAGG TG

Translation


          K  *  T  F  K  C  K  S  S  *  *  K  M  A  K  *  R  *  I  S  I  F  R  W  S  C  N  W  I  S  L  L  F  I   F1
           S  K  H  L  N  V  N  P  A  D  E  K  W  L  N  R  D  R  L  V  F  S  G  G  H  A  T  G  L  V  Y  S  L     F2
            V  N  I  *  M  *  I  Q  L  M  K  N  G  *  I  E  I  D  *  Y  F  Q  V  V  M  Q  L  D  *  F  T  L  Y    F3
        1 AAGTAAACATTTAAATGTAAATCCAGCTGATGAAAAATGGCTAAATAGAGATAGATTAGTATTTTCAGGTGGTCATGCAACTGGATTAGTTTACTCTTTA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            T  S  L  G  I  *  C  I  Y  K  *  Y  *  K  L  *  T  N  S  L  *  N  S  R  T  S  R  I  W  S  Y  S  W    F1
          L  H  L  W  G  F  N  V  S  I  N  D  I  K  N  F  R  Q  T  H  S  K  T  P  G  H  P  E  Y  G  H  T  H  G   F2
           Y  I  F  G  D  L  M  Y  L  *  M  I  L  K  T  L  D  K  L  T  L  K  L  Q  D  I  Q  N  M  V  I  L  M     F3
      101 TTACATCTTTGGGGATTTAATGTATCTATAAATGATATTAAAAACTTTAGACAAACTCACTCTAAAACTCCAGGACATCCAGAATATGGTCATACTCATG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           N  *  N  Y  N  R  T  F  R  T  R  N  C  K  C  S  W  I  C  N  G  R  K  I  C  T  K  S  S  W  K  *  C     F1
            I  E  I  T  T  G  P  L  G  Q  G  I  A  N  A  V  G  F  A  M  A  G  K  Y  A  Q  N  L  L  G  S  D  V    F2
          E  L  K  L  Q  Q  D  L  *  D  K  E  L  Q  M  Q  L  D  L  Q  W  Q  E  N  M  H  K  I  F  L  E  V  M  *   F3
      201 GAATTGAAATTACAACAGGACCTTTAGGACAAGGAATTGCAAATGCAGTTGGATTTGCAATGGCAGGAAAATATGCACAAAATCTTCTTGGAAGTGATGT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          N  Q  S  *  S  L  L  F  M  W  *  W  R  L  T  R  R  Y  F  L  *  S  N  S  N  S  R  T  F  K  T  *  *  S   F1
           I  N  H  K  V  Y  C  L  C  G  D  G  D  L  Q  E  G  I  S  Y  E  A  T  A  T  A  G  H  L  K  L  D  N     F2
            S  I  I  K  F  T  V  Y  V  V  M  E  T  Y  K  K  V  F  L  M  K  Q  Q  Q  Q  Q  D  I  *  N  L  I  I    F3
      301 AATCAATCATAAAGTTTACTGTTTATGTGGTGATGGAGACTTACAAGAAGGTATTTCTTATGAAGCAACAGCAACAGCAGGACATTTAAAACTTGATAAT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            C  D  N  L  *  F  K  F  N  H  N  *  R  *  Y  K  Y  F  L  E  *  K  C  *  K  K  I  S  S  Y  *  F  *    F1
          L  V  I  I  Y  D  S  N  S  I  T  I  E  G  D  T  S  I  S  W  S  E  N  V  K  K  R  F  Q  A  I  D  F  E   F2
           L  *  *  F  M  I  Q  I  Q  S  Q  L  K  V  I  Q  V  F  L  G  V  K  M  L  K  K  D  F  K  L  L  I  L     F3
      401 CTTGTGATAATTTATGATTCAAATTCAATCACAATTGAAGGTGATACAAGTATTTCTTGGAGTGAAAATGTTAAAAAAAGATTTCAAGCTATTGATTTTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           S  N  R  N  *  W  T  *  F  *  S  N  *  *  S  F  S  C  S  *  I  I  N  S  S  S  I  N  Y  C  K  N  S     F1
            V  I  E  I  D  G  H  N  F  D  Q  I  D  K  A  L  V  A  A  K  S  S  T  L  P  V  L  I  I  A  K  T  A    F2
          K  *  *  K  L  M  D  I  I  L  I  K  L  I  K  L  *  L  Q  L  N  H  Q  L  F  Q  Y  *  L  L  Q  K  Q  Q   F3
      501 AAGTAATAGAAATTGATGGACATAATTTTGATCAAATTGATAAAGCTTTAGTTGCAGCTAAATCATCAACTCTTCCAGTATTAATTATTGCAAAAACAGC 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          N  C  K  R  C  S  N  N  G  R  K  P  P  F  S  W  S  T  V  R  X                                          F1
           I  A  K  G  A  V  T  M  E  G  S  H  H  S  H  G  A  P  L  G  X                                         F2
            L  Q  K  V  Q  *  Q  W  K  E  A  T  I  L  M  E  H  R  *  V                                           F3
      601 AATTGCAAAAGGTGCAGTAACAATGGAAGGAAGCCACCATTCTCATGGAGCACCGTTAGGTG 662
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