pgm allele sequence: id-1014

Contig position

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50
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end
118823
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orientation
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complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

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Translation


          N  N  S  *  L  C  Q  W  C  C  L  *  S  R  S  N  N  F  R  R  V  R  C  R  C  Y  N  N  K  Q  *  T  K  W   F1
           I  I  L  D  C  A  N  G  A  A  Y  K  V  G  P  T  I  L  E  E  L  G  A  D  V  I  T  I  N  N  K  P  N     F2
            *  F  L  I  V  P  M  V  L  L  I  K  *  V  Q  Q  F  *  K  S  *  V  Q  M  L  *  Q  *  T  I  N  Q  M    F3
        1 AATAATTCTTGATTGTGCCAATGGTGCTGCTTATAAAGTAGGTCCAACAATTTTAGAAGAGTTAGGTGCAGATGTTATAACAATAAACAATAAACCAAAT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            F  *  Y  K  *  K  L  W  S  N  A  S  *  N  C  F  *  F  S  K  R  V  S  S  R  Y  W  T  C  T  *  W  *    F1
          G  F  N  I  N  E  N  C  G  A  M  H  P  E  T  V  S  N  L  V  K  E  Y  R  A  D  I  G  L  A  L  D  G  D   F2
           V  L  I  *  M  K  I  V  E  Q  C  I  L  K  L  F  L  I  *  *  K  S  I  E  Q  I  L  D  L  H  L  M  V     F3
      101 GGTTTTAATATAAATGAAAATTGTGGAGCAATGCATCCTGAAACTGTTTCTAATTTAGTAAAAGAGTATCGAGCAGATATTGGACTTGCACTTGATGGTG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           C  *  *  I  G  C  D  *  *  K  R  *  N  C  R  R  R  *  P  S  W  S  I  E  C  L  F  K  K  *  K  S  F     F1
            A  D  R  L  V  V  I  D  E  K  G  E  I  V  D  G  D  N  L  L  G  A  L  S  V  Y  L  K  N  E  N  L  L    F2
          M  L  I  D  W  L  *  L  M  K  K  V  K  L  S  T  E  I  T  F  L  E  H  *  V  F  I  *  K  M  K  I  F  *   F3
      201 ATGCTGATAGATTGGTTGTGATTGATGAAAAAGGTGAAATTGTCGACGGAGATAACCTTCTTGGAGCATTGAGTGTTTATTTAAAAAATGAAAATCTTTT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          K  R  *  C  L  C  S  D  S  Y  V  K  *  S  I  R  R  L  F  T  K  K  *  N  L  F  I  *  I  K  C  W  *  *   F1
           K  G  D  A  C  V  A  T  V  M  S  N  K  A  L  E  D  Y  L  Q  K  N  K  I  S  L  F  R  S  N  V  G  D     F2
            K  V  M  L  V  *  R  Q  L  C  Q  I  K  H  *  K  T  I  Y  K  K  I  K  S  L  Y  L  D  Q  M  L  V  I    F3
      301 AAAAGGTGATGCTTGTGTAGCGACAGTTATGTCAAATAAAGCATTAGAAGACTATTTACAAAAAAATAAAATCTCTTTATTTAGATCAAATGTTGGTGAT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            I  R  F  R  S  Y  E  R  K  R  Y  K  F  W  R  R  T  K  W  T  Y  N  L  L  *  Y  C  K  N  W  R  W  I    F1
          K  Y  V  L  E  V  M  K  E  K  G  I  N  F  G  G  E  Q  S  G  H  I  I  F  S  D  I  A  K  T  G  D  G  L   F2
           N  T  F  *  K  L  *  K  K  K  V  *  I  L  E  E  N  K  V  D  I  *  S  S  L  I  L  Q  K  L  E  M  D     F3
      401 AAATACGTTTTAGAAGTTATGAAAGAAAAAGGTATAAATTTTGGAGGAGAACAAAGTGGACATATAATCTTCTCTGATATTGCAAAAACTGGAGATGGAT 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  F  C  F  T  S  F  S  T  N  Y  K  I  R  *  K  S  K  *  D  F  K  S  I  *  F  I  S  S  N  F  T  *     F1
            A  S  A  L  Q  V  L  A  L  I  I  K  S  G  K  K  A  S  E  I  L  N  P  F  S  L  Y  P  Q  I  L  H  N    F2
          W  L  L  L  Y  K  F  *  H  *  L  *  N  Q  V  K  K  Q  V  R  F  *  I  H  L  V  Y  I  L  K  F  Y  I  I   F3
      501 TGGCTTCTGCTTTACAAGTTTTAGCACTAATTATAAAATCAGGTAAAAAAGCAAGTGAGATTTTAAATCCATTTAGTTTATATCCTCAAATTTTACATAA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          Y  E  S  Y  G  K  N  S  F  R  T  N  Y  W  I  R  R  S  F  K  T  N  *  T  K  R  F  K  R  F  D  *  I  L   F1
           M  K  V  T  G  K  I  P  L  E  Q  I  T  G  L  E  E  V  L  K  P  I  R  Q  K  G  L  R  D  L  I  R  Y     F2
            *  K  L  R  E  K  F  L  *  N  K  L  L  D  *  K  K  F  *  N  Q  L  D  K  K  V  *  E  I  *  L  D  T    F3
      601 TATGAAAGTTACGGGAAAAATTCCTTTAGAACAAATTACTGGATTAGAAGAAGTTTTAAAACCAATTAGACAAAAAGGTTTAAGAGATTTGATTAGATAC 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            X                                                                                                    F1
          S                                                                                                      F2
           L                                                                                                     F3
      701 TCT 703
          ---