glyA allele sequence: id-1014
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- Illumina
Sequence
TGCAAATGTT CAACCACACT CAGGAAGCCA AGCTAATGGA GCAGTATATG CAGCATTAAT AAAAGCTGGT GATAAAATCT TAGGTATGGA TTTATCTCAT GGTGGACATT TAACTCATGG TTCTAAACCA TCATTTTCTG GACAAAACTA TCAAGCATTC TATTATGGAG TTGAACTTGA TGGAAGAATT AATTATGATA AAGTTGAAGA GATAGCAAAA ATAGTTCAAC CAAAAATAAT CGTTTGTGGT GCTTCTGCAT ACGCAAGAGA AATTGACTTC AAAAGATTTA GAGAAATAGC AGATTCAGTT GGTGCTATTT TATTTGCAGA TATTGCACAT ATTGCAGGTC TTGTAGCAGC TAATGAACAT CCAAGCCCAT TTCCTCATGC ACATATAGTT ACAACTACTA CTCATAAGAC TTTAAGAGGT CCAAGAGGTG GTATGATAAT GACAAATGAT GAAGAGATAG CTAAAAAAAT AAACTCAGCT ATTTTCCCAG GACTTCAAGG TGGACCATTA GTTCATGTAA TAGCTGCAAA AGCAGTAGCA TTTAAAGAGA TACTTGATCC AAAATGGAAA GATTATGCAA AACAAGTAAA AGCAAATGCA AAAGTGTTAG GAGAAGTTCT AACAAAAAGA GGATATGATA TAGTAAGTGG TGGAACAGAT AATCACTTAG TATTAGTAAG TTTTTTAAAT AAACCAT
Translation
C K C S T T L R K P S * W S S I C S I N K S W * * N L R Y G F I S W F1
A N V Q P H S G S Q A N G A V Y A A L I K A G D K I L G M D L S H F2
Q M F N H T Q E A K L M E Q Y M Q H * * K L V I K S * V W I Y L M F3
1 TGCAAATGTTCAACCACACTCAGGAAGCCAAGCTAATGGAGCAGTATATGCAGCATTAATAAAAGCTGGTGATAAAATCTTAGGTATGGATTTATCTCAT 100
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W T F N S W F * T I I F W T K L S S I L L W S * T * W K N * L * * F1
G G H L T H G S K P S F S G Q N Y Q A F Y Y G V E L D G R I N Y D K F2
V D I * L M V L N H H F L D K T I K H S I M E L N L M E E L I M I F3
101 GGTGGACATTTAACTCATGGTTCTAAACCATCATTTTCTGGACAAAACTATCAAGCATTCTATTATGGAGTTGAACTTGATGGAAGAATTAATTATGATA 200
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S * R D S K N S S T K N N R L W C F C I R K R N * L Q K I * R N S F1
V E E I A K I V Q P K I I V C G A S A Y A R E I D F K R F R E I A F2
K L K R * Q K * F N Q K * S F V V L L H T Q E K L T S K D L E K * Q F3
201 AAGTTGAAGAGATAGCAAAAATAGTTCAACCAAAAATAATCGTTTGTGGTGCTTCTGCATACGCAAGAGAAATTGACTTCAAAAGATTTAGAGAAATAGC 300
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R F S W C Y F I C R Y C T Y C R S C S S * * T S K P I S S C T Y S Y F1
D S V G A I L F A D I A H I A G L V A A N E H P S P F P H A H I V F2
I Q L V L F Y L Q I L H I L Q V L * Q L M N I Q A H F L M H I * L F3
301 AGATTCAGTTGGTGCTATTTTATTTGCAGATATTGCACATATTGCAGGTCTTGTAGCAGCTAATGAACATCCAAGCCCATTTCCTCATGCACATATAGTT 400
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N Y Y S * D F K R S K R W Y D N D K * * R D S * K N K L S Y F P R F1
T T T T H K T L R G P R G G M I M T N D E E I A K K I N S A I F P G F2
Q L L L I R L * E V Q E V V * * * Q M M K R * L K K * T Q L F S Q F3
401 ACAACTACTACTCATAAGACTTTAAGAGGTCCAAGAGGTGGTATGATAATGACAAATGATGAAGAGATAGCTAAAAAAATAAACTCAGCTATTTTCCCAG 500
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T S R W T I S S C N S C K S S S I * R D T * S K M E R L C K T S K F1
L Q G G P L V H V I A A K A V A F K E I L D P K W K D Y A K Q V K F2
D F K V D H * F M * * L Q K Q * H L K R Y L I Q N G K I M Q N K * K F3
501 GACTTCAAGGTGGACCATTAGTTCATGTAATAGCTGCAAAAGCAGTAGCATTTAAAGAGATACTTGATCCAAAATGGAAAGATTATGCAAAACAAGTAAA 600
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S K C K S V R R S S N K K R I * Y S K W W N R * S L S I S K F F K * F1
A N A K V L G E V L T K R G Y D I V S G G T D N H L V L V S F L N F2
Q M Q K C * E K F * Q K E D M I * * V V E Q I I T * Y * * V F * I F3
601 AGCAAATGCAAAAGTGTTAGGAGAAGTTCTAACAAAAAGAGGATATGATATAGTAAGTGGTGGAACAGATAATCACTTAGTATTAGTAAGTTTTTTAAAT 700
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T X F1
K P X F2
N H F3
701 AAACCAT 707
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