recA allele sequence: id-720

Contig position

sequence bin id
1487
contig length
297108
start
78700
end
79260
length
561
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

CTTAGCCCAA CTTCACTTTT ACTCACGATT TCCAGCGGAG ATTGGCATGG ATCAGAACAA ACAGAAGGCA CTGGCGGCTG CGCTGGGTCA AATCGAAAAG CAGTTTGGCA AAGGCTCCAT CATGCGTCTG GGCGACAGCA AGACCATGGA TATCGAAGCC ATCTCCACCG GCTCCCTCTC CCTGGACGTG GCGCTGGGCA TCGGTGGCCT GCCGTGCGGT CGTATCGTCG AGATCTATGG CCCGGAATCC TCCGGTAAAA CCACGCTGAC CCTGCAGGTG ATCGCCGAAG CACAGAAGAA GGGCAAGACC TGCGCCTTCG TCGATGCGGA GCACGCGCTC GATCCCATCT ATGCCGCCAA GCTGGGCGTC AACGTCGACG ACCTCCTGAT CTCCCAGCCG GATACTGGTG AACAGGCGCT GGAAATCTGC GACATGCTGG TGCGCTCCAA CGCCGTTGAC GTCATCATCG TCGACTCCGT GGCAGCCCTG ACCCCGAAAG CGGAAATCGA AGGCGAGATG GGGGATTCCC ACGTCGGCCT GCAGGCCCGT CTGATGTCCC AGGCGCTGCG CAAACTGACC GCCAACATCA AGAACGCCAA CTGCCTGTGC ATCTTCATCA ACCAGATCCG GATGAAGATC GGCGTCATGT TCGGCAGCCC GGAGACCACC ACGGGTGGTA ACGCGCTCAA GTTCTACGCC TCCGTGCGTC TGGATATCCG TCGCATCGGC GCCATCAAGG AAGGTGACGA AGTGGTCGGT A

Translation


          L  S  P  T  S  L  L  L  T  I  S  S  G  D  W  H  G  S  E  Q  T  E  G  T  G  G  C  A  G  S  N  R  K  A   F1
           L  A  Q  L  H  F  Y  S  R  F  P  A  E  I  G  M  D  Q  N  K  Q  K  A  L  A  A  A  L  G  Q  I  E  K     F2
            *  P  N  F  T  F  T  H  D  F  Q  R  R  L  A  W  I  R  T  N  R  R  H  W  R  L  R  W  V  K  S  K  S    F3
        1 CTTAGCCCAACTTCACTTTTACTCACGATTTCCAGCGGAGATTGGCATGGATCAGAACAAACAGAAGGCACTGGCGGCTGCGCTGGGTCAAATCGAAAAG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            V  W  Q  R  L  H  H  A  S  G  R  Q  Q  D  H  G  Y  R  S  H  L  H  R  L  P  L  P  G  R  G  A  G  H    F1
          Q  F  G  K  G  S  I  M  R  L  G  D  S  K  T  M  D  I  E  A  I  S  T  G  S  L  S  L  D  V  A  L  G  I   F2
           S  L  A  K  A  P  S  C  V  W  A  T  A  R  P  W  I  S  K  P  S  P  P  A  P  S  P  W  T  W  R  W  A     F3
      101 CAGTTTGGCAAAGGCTCCATCATGCGTCTGGGCGACAGCAAGACCATGGATATCGAAGCCATCTCCACCGGCTCCCTCTCCCTGGACGTGGCGCTGGGCA 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  W  P  A  V  R  S  Y  R  R  D  L  W  P  G  I  L  R  *  N  H  A  D  P  A  G  D  R  R  S  T  E  E     F1
            G  G  L  P  C  G  R  I  V  E  I  Y  G  P  E  S  S  G  K  T  T  L  T  L  Q  V  I  A  E  A  Q  K  K    F2
          S  V  A  C  R  A  V  V  S  S  R  S  M  A  R  N  P  P  V  K  P  R  *  P  C  R  *  S  P  K  H  R  R  R   F3
      201 TCGGTGGCCTGCCGTGCGGTCGTATCGTCGAGATCTATGGCCCGGAATCCTCCGGTAAAACCACGCTGACCCTGCAGGTGATCGCCGAAGCACAGAAGAA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  Q  D  L  R  L  R  R  C  G  A  R  A  R  S  H  L  C  R  Q  A  G  R  Q  R  R  R  P  P  D  L  P  A  G   F1
           G  K  T  C  A  F  V  D  A  E  H  A  L  D  P  I  Y  A  A  K  L  G  V  N  V  D  D  L  L  I  S  Q  P     F2
            A  R  P  A  P  S  S  M  R  S  T  R  S  I  P  S  M  P  P  S  W  A  S  T  S  T  T  S  *  S  P  S  R    F3
      301 GGGCAAGACCTGCGCCTTCGTCGATGCGGAGCACGCGCTCGATCCCATCTATGCCGCCAAGCTGGGCGTCAACGTCGACGACCTCCTGATCTCCCAGCCG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            Y  W  *  T  G  A  G  N  L  R  H  A  G  A  L  Q  R  R  *  R  H  H  R  R  L  R  G  S  P  D  P  E  S    F1
          D  T  G  E  Q  A  L  E  I  C  D  M  L  V  R  S  N  A  V  D  V  I  I  V  D  S  V  A  A  L  T  P  K  A   F2
           I  L  V  N  R  R  W  K  S  A  T  C  W  C  A  P  T  P  L  T  S  S  S  S  T  P  W  Q  P  *  P  R  K     F3
      401 GATACTGGTGAACAGGCGCTGGAAATCTGCGACATGCTGGTGCGCTCCAACGCCGTTGACGTCATCATCGTCGACTCCGTGGCAGCCCTGACCCCGAAAG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  N  R  R  R  D  G  G  F  P  R  R  P  A  G  P  S  D  V  P  G  A  A  Q  T  D  R  Q  H  Q  E  R  Q     F1
            E  I  E  G  E  M  G  D  S  H  V  G  L  Q  A  R  L  M  S  Q  A  L  R  K  L  T  A  N  I  K  N  A  N    F2
          R  K  S  K  A  R  W  G  I  P  T  S  A  C  R  P  V  *  C  P  R  R  C  A  N  *  P  P  T  S  R  T  P  T   F3
      501 CGGAAATCGAAGGCGAGATGGGGGATTCCCACGTCGGCCTGCAGGCCCGTCTGATGTCCCAGGCGCTGCGCAAACTGACCGCCAACATCAAGAACGCCAA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          L  P  V  H  L  H  Q  P  D  P  D  E  D  R  R  H  V  R  Q  P  G  D  H  H  G  W  *  R  A  Q  V  L  R  L   F1
           C  L  C  I  F  I  N  Q  I  R  M  K  I  G  V  M  F  G  S  P  E  T  T  T  G  G  N  A  L  K  F  Y  A     F2
            A  C  A  S  S  S  T  R  S  G  *  R  S  A  S  C  S  A  A  R  R  P  P  R  V  V  T  R  S  S  S  T  P    F3
      601 CTGCCTGTGCATCTTCATCAACCAGATCCGGATGAAGATCGGCGTCATGTTCGGCAGCCCGGAGACCACCACGGGTGGTAACGCGCTCAAGTTCTACGCC 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  A  S  G  Y  P  S  H  R  R  H  Q  G  R  *  R  S  G  R  X                                           F1
          S  V  R  L  D  I  R  R  I  G  A  I  K  E  G  D  E  V  V  G  X                                          F2
           P  C  V  W  I  S  V  A  S  A  P  S  R  K  V  T  K  W  S  V                                            F3
      701 TCCGTGCGTCTGGATATCCGTCGCATCGGCGCCATCAAGGAAGGTGACGAAGTGGTCGGTA 761
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