ppsA allele sequence: id-720
Contig position
- sequence bin id
- 1529
- contig length
- 55414
- start
- 20135
- end
- 20671
- length
- 537
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CTTCTGGCCG GAGCGGGTGA TCGTGCGGAT GTCGGACTTC AAGTCCAACG AGTACGCCAA CCTGGTGGGC GGCCGTGGCT ACGAGCCGCA CGAAGAGAAC CCGATGATCG GTTTTCGTGG TGCGTCGCGC TACATCGCCG ACAGCTTCCG CCCCTGTTTT GCCCTCGAGT GCGAGGCAAT CAAGCGGGTG CGCGATGTCA TGGGGCTGAC CAACGTCGAG GTGATGATCC CCTTCGTGCG CACCGTGGGC GAGGCGGAGC AGGTGATTGA CATCCTGGCC GAGAACGGTC TGCGCCGTGG CGAGCGGGGG CTCAAGGTGA TCATGATGTG CGAGATCCCG AGCAACGCCC TCCTGGCAGA CAAGTTCCTC GAGCACGTGG ACGGCTTCTC CATCGGCTCC AACGACATGA CCCAGCTGAC CCTTGGTCTG GACCGGGACT CCGGGCTTAT CGCCCACCTG TTCGACGAGC GCAACGAGGC GGTCAAGGCG CTGCTGGCGA TGGCCATTGC CGCCGCCCGC AAGGCTGGCA AGTACGTGGG GATCTGCGGC CAGGGGCCAT CCGATCACCC GGACTTCGCC GCCTGGCTGG TCGAGCAGGG CATCGACTCT GTGTCGCTCA ACCCGGATAC CGTGGTCGAC ACCTGGCTCT ATCTGGCCGA GCAGCACAAG GCGAACTGAC GCAGGCTGCA CACCCCCCCA CCAAAATGGC GCCCACGGGC GCCATTTTTC ATGGCCG
Translation
L L A G A G D R A D V G L Q V Q R V R Q P G G R P W L R A A R R E P F1
F W P E R V I V R M S D F K S N E Y A N L V G G R G Y E P H E E N F2
S G R S G * S C G C R T S S P T S T P T W W A A V A T S R T K R T F3
1 CTTCTGGCCGGAGCGGGTGATCGTGCGGATGTCGGACTTCAAGTCCAACGAGTACGCCAACCTGGTGGGCGGCCGTGGCTACGAGCCGCACGAAGAGAAC 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
D D R F S W C V A L H R R Q L P P L F C P R V R G N Q A G A R C H F1
P M I G F R G A S R Y I A D S F R P C F A L E C E A I K R V R D V M F2
R * S V F V V R R A T S P T A S A P V L P S S A R Q S S G C A M S F3
101 CCGATGATCGGTTTTCGTGGTGCGTCGCGCTACATCGCCGACAGCTTCCGCCCCTGTTTTGCCCTCGAGTGCGAGGCAATCAAGCGGGTGCGCGATGTCA 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G A D Q R R G D D P L R A H R G R G G A G D * H P G R E R S A P W F1
G L T N V E V M I P F V R T V G E A E Q V I D I L A E N G L R R G F2
W G * P T S R * * S P S C A P W A R R S R * L T S W P R T V C A V A F3
201 TGGGGCTGACCAACGTCGAGGTGATGATCCCCTTCGTGCGCACCGTGGGCGAGGCGGAGCAGGTGATTGACATCCTGGCCGAGAACGGTCTGCGCCGTGG 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R A G A Q G D H D V R D P E Q R P P G R Q V P R A R G R L L H R L Q F1
E R G L K V I M M C E I P S N A L L A D K F L E H V D G F S I G S F2
S G G S R * S * C A R S R A T P S W Q T S S S S T W T A S P S A P F3
301 CGAGCGGGGGCTCAAGGTGATCATGATGTGCGAGATCCCGAGCAACGCCCTCCTGGCAGACAAGTTCCTCGAGCACGTGGACGGCTTCTCCATCGGCTCC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R H D P A D P W S G P G L R A Y R P P V R R A Q R G G Q G A A G D F1
N D M T Q L T L G L D R D S G L I A H L F D E R N E A V K A L L A M F2
T T * P S * P L V W T G T P G L S P T C S T S A T R R S R R C W R F3
401 AACGACATGACCCAGCTGACCCTTGGTCTGGACCGGGACTCCGGGCTTATCGCCCACCTGTTCGACGAGCGCAACGAGGCGGTCAAGGCGCTGCTGGCGA 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G H C R R P Q G W Q V R G D L R P G A I R S P G L R R L A G R A G F1
A I A A A R K A G K Y V G I C G Q G P S D H P D F A A W L V E Q G F2
W P L P P P A R L A S T W G S A A R G H P I T R T S P P G W S S R A F3
501 TGGCCATTGCCGCCGCCCGCAAGGCTGGCAAGTACGTGGGGATCTGCGGCCAGGGGCCATCCGATCACCCGGACTTCGCCGCCTGGCTGGTCGAGCAGGG 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
H R L C V A Q P G Y R G R H L A L S G R A A Q G E L T Q A A H P P T F1
I D S V S L N P D T V V D T W L Y L A E Q H K A N * R R L H T P P F2
S T L C R S T R I P W S T P G S I W P S S T R R T D A G C T P P H F3
601 CATCGACTCTGTGTCGCTCAACCCGGATACCGTGGTCGACACCTGGCTCTATCTGGCCGAGCAGCACAAGGCGAACTGACGCAGGCTGCACACCCCCCCA 700
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
K M A P T G A I F H G R F1
P K W R P R A P F F M A X F2
Q N G A H G R H F S W P F3
701 CCAAAATGGCGCCCACGGGCGCCATTTTTCATGGCCG 737
----:----|----:----|----:----|----:--