gyrB allele sequence: id-720
Contig position
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- yes
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- Illumina
Sequence
CCTGGTGGGC TTCCGTACCG CGCTGACCCG TACTCTGAAC TCCTACATGG ACAAAGAGGA CTACAGCAAG AAGGCCAAGT CTGCCGCCAG TGGCGACGAC GTGCGTGAAG GTCTGATTGC CGTTATCTCC GTCAAGGTGC CGGATCCCAA GTTCTCCTCC CAGACCAAGG ACAAGCTGGT CTCTTCCGAA GTGAAGACCG CCGTCGAACA GGCGATGGGT GAGAAGCTGG CCGACTTCCT GCTGGAAAAC CCGGGCGATG CCAAGATCGT GGTCAACAAG ATCATCGATG CGGCCCGTGC CCGCGAAGCG GCCCGCAAGG CCCGTGAACT GACCCGTCGC AAAGGCGCGC TGGATATCGC CGGTCTGCCC GGCAAGCTGG CTGACTGTCA GGAAAAAGAC CCGGCTCTTT CCGAACTCTA CATAGTGGAA GGGGACTCTG CTGGTGGTTC CGCCAAGCAG GGTCGCAACC GGAAGAACCA GGCCATCCTG CCGCTCAAGG GCAAGATCCT GAACGTGGAG AAGGCCCGTT TCGACAAGAT GATCTCCTCC CAGGAGGTGG GCACCCTGAT CACCGCACTG GGTTGCGGTA TCGGTCGTGA CGAGTACAAC CCGGACAAGC TGCGTTATCA CAACATCATC ATCATGACCG ATGCGGACGT CGATGGTGCG CACATCC
Translation
P G G L P Y R A D P Y S E L L H G Q R G L Q Q E G Q V C R Q W R R R F1
L V G F R T A L T R T L N S Y M D K E D Y S K K A K S A A S G D D F2
W W A S V P R * P V L * T P T W T K R T T A R R P S L P P V A T T F3
1 CCTGGTGGGCTTCCGTACCGCGCTGACCCGTACTCTGAACTCCTACATGGACAAAGAGGACTACAGCAAGAAGGCCAAGTCTGCCGCCAGTGGCGACGAC 100
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A * R S D C R Y L R Q G A G S Q V L L P D Q G Q A G L F R S E D R F1
V R E G L I A V I S V K V P D P K F S S Q T K D K L V S S E V K T A F2
C V K V * L P L S P S R C R I P S S P P R P R T S W S L P K * R P F3
101 GTGCGTGAAGGTCTGATTGCCGTTATCTCCGTCAAGGTGCCGGATCCCAAGTTCTCCTCCCAGACCAAGGACAAGCTGGTCTCTTCCGAAGTGAAGACCG 200
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R R T G D G * E A G R L P A G K P G R C Q D R G Q Q D H R C G P C F1
V E Q A M G E K L A D F L L E N P G D A K I V V N K I I D A A R A F2
P S N R R W V R S W P T S C W K T R A M P R S W S T R S S M R P V P F3
201 CCGTCGAACAGGCGATGGGTGAGAAGCTGGCCGACTTCCTGCTGGAAAACCCGGGCGATGCCAAGATCGTGGTCAACAAGATCATCGATGCGGCCCGTGC 300
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P R S G P Q G P * T D P S Q R R A G Y R R S A R Q A G * L S G K R P F1
R E A A R K A R E L T R R K G A L D I A G L P G K L A D C Q E K D F2
A K R P A R P V N * P V A K A R W I S P V C P A S W L T V R K K T F3
301 CCGCGAAGCGGCCCGCAAGGCCCGTGAACTGACCCGTCGCAAAGGCGCGCTGGATATCGCCGGTCTGCCCGGCAAGCTGGCTGACTGTCAGGAAAAAGAC 400
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G S F R T L H S G R G L C W W F R Q A G S Q P E E P G H P A A Q G F1
P A L S E L Y I V E G D S A G G S A K Q G R N R K N Q A I L P L K G F2
R L F P N S T * W K G T L L V V P P S R V A T G R T R P S C R S R F3
401 CCGGCTCTTTCCGAACTCTACATAGTGGAAGGGGACTCTGCTGGTGGTTCCGCCAAGCAGGGTCGCAACCGGAAGAACCAGGCCATCCTGCCGCTCAAGG 500
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Q D P E R G E G P F R Q D D L L P G G G H P D H R T G L R Y R S * F1
K I L N V E K A R F D K M I S S Q E V G T L I T A L G C G I G R D F2
A R S * T W R R P V S T R * S P P R R W A P * S P H W V A V S V V T F3
501 GCAAGATCCTGAACGTGGAGAAGGCCCGTTTCGACAAGATGATCTCCTCCCAGGAGGTGGGCACCCTGATCACCGCACTGGGTTGCGGTATCGGTCGTGA 600
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R V Q P G Q A A L S Q H H H H D R C G R R W C A H P F1
E Y N P D K L R Y H N I I I M T D A D V D G A H I X F2
S T T R T S C V I T T S S S * P M R T S M V R T S F3
601 CGAGTACAACCCGGACAAGCTGCGTTATCACAACATCATCATCATGACCGATGCGGACGTCGATGGTGCGCACATCC 677
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