groL allele sequence: id-720

Contig position

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1460
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7801
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8310
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510
orientation
reverse
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yes
method
Illumina
Options

Sequence

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Translation


          R  Y  H  Y  R  Y  R  T  G  S  S  H  R  Q  R  R  P  E  G  R  C  C  R  H  E  P  D  G  S  E  A  R  Y  R   F1
           G  T  T  T  A  T  V  L  A  Q  A  I  V  N  E  G  L  K  A  V  A  A  G  M  N  P  M  D  L  K  R  G  I     F2
            V  P  L  P  L  P  Y  W  L  K  P  S  S  T  K  A  *  R  P  L  L  P  A  *  T  R  W  I  *  S  A  V  S    F3
        1 CGGTACCACTACCGCTACCGTACTGGCTCAAGCCATCGTCAACGAAGGCCTGAAGGCCGTTGCTGCCGGCATGAACCCGATGGATCTGAAGCGCGGTATC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            Q  G  R  G  G  R  R  C  R  A  A  S  A  V  P  A  V  C  R  Q  Q  C  H  R  S  G  R  H  H  L  R  Q  L    F1
          D  K  A  V  V  A  A  V  A  E  L  Q  A  L  S  Q  P  C  A  D  N  N  A  I  A  Q  V  G  T  I  S  A  N  S   F2
           T  R  P  W  W  P  P  L  P  S  C  K  R  C  P  S  R  V  P  T  T  M  P  S  L  R  S  A  P  S  P  P  T     F3
      101 GACAAGGCCGTGGTGGCCGCCGTTGCCGAGCTGCAAGCGCTGTCCCAGCCGTGTGCCGACAACAATGCCATCGCTCAGGTCGGCACCATCTCCGCCAACT 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  R  E  S  G  Q  A  D  C  R  S  H  G  Q  S  W  S  *  R  R  H  H  S  *  R  W  S  G  S  G  R  R  A     F1
            D  E  K  V  G  K  L  I  A  E  A  M  D  K  V  G  R  D  G  V  I  T  V  E  D  G  Q  G  L  D  D  E  L    F2
          P  T  R  K  W  A  S  *  L  P  K  P  W  T  K  L  V  V  T  A  S  S  Q  L  K  M  V  R  V  W  T  T  S  W   F3
      201 CCGACGAGAAAGTGGGCAAGCTGATTGCCGAAGCCATGGACAAAGTTGGTCGTGACGGCGTCATCACAGTTGAAGATGGTCAGGGTCTGGACGACGAGCT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  R  G  R  R  H  A  V  R  P  W  L  P  L  P  V  L  R  Q  Q  A  G  N  R  C  R  *  A  G  R  S  L  H  P   F1
           A  V  V  E  G  M  Q  F  D  R  G  Y  L  S  P  Y  F  V  N  K  P  E  T  G  A  V  E  L  D  D  P  F  I     F2
            P  W  *  K  A  C  S  S  T  V  A  T  S  P  R  T  S  S  T  S  R  K  P  V  P  L  S  W  T  I  P  S  S    F3
      301 GGCCGTGGTAGAAGGCATGCAGTTCGACCGTGGCTACCTCTCCCCGTACTTCGTCAACAAGCCGGAAACCGGTGCCGTTGAGCTGGACGATCCCTTCATC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  G  *  Q  E  S  L  Q  H  P  *  N  A  A  G  T  G  R  R  S  Q  S  G  Q  T  A  D  H  R  G  *  R  R    F1
          L  L  V  D  K  K  V  S  N  I  R  E  M  L  P  V  L  E  G  V  A  K  A  G  K  P  L  I  I  V  A  E  D  V   F2
           C  W  L  T  R  K  S  P  T  S  V  K  C  C  R  Y  W  K  A  *  P  K  R  A  N  R  *  S  S  W  L  K  T     F3
      401 CTGCTGGTTGACAAGAAAGTCTCCAACATCCGTGAAATGCTGCCGGTACTGGAAGGCGTAGCCAAAGCGGGCAAACCGCTGATCATCGTGGCTGAAGACG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  R  R  S  A  G  D  P  G  G  Q  H  H  A  W  H  R  E  S  R  C  R  Q  G  T  W  L  R  *  P  S  Q  S     F1
            E  G  E  A  L  A  T  L  V  V  N  T  M  R  G  I  V  K  V  A  A  V  K  A  P  G  F  G  D  R  R  K  A    F2
          *  K  A  K  R  W  R  P  W  W  S  T  P  C  V  A  S  *  K  S  L  P  S  R  H  L  A  S  V  T  V  A  K  P   F3
      501 TAGAAGGCGAAGCGCTGGCGACCCTGGTGGTCAACACCATGCGTGGCATCGTGAAAGTCGCTGCCGTCAAGGCACCTGGCTTCGGTGACCGTCGCAAAGC 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          H  A  A  G  Y  R  H  P  D  R  W  Y  R  D  L  R  R  S  G  H  G  A  G  K  S  D  P  G  R  P  G  P  C  Q   F1
           M  L  Q  D  I  A  I  L  T  G  G  T  V  I  S  E  E  V  G  M  E  L  E  K  A  T  L  E  D  L  G  R  A     F2
            C  C  R  I  S  P  S  *  P  V  V  P  *  S  P  K  K  W  A  W  S  W  K  K  R  P  W  K  T  W  A  V  P    F3
      601 CATGCTGCAGGATATCGCCATCCTGACCGGTGGTACCGTGATCTCCGAAGAAGTGGGCATGGAGCTGGAAAAAGCGACCCTGGAAGACCTGGGCCGTGCC 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  H  R                                                                                              F1
          K  R  I  X                                                                                             F2
           S  A  S                                                                                               F3
      701 AAGCGCATCG 710
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