gltA allele sequence: id-720

Contig position

sequence bin id
1499
contig length
261390
start
180984
end
181478
length
495
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

TCTGCTTTCC AAGATGCCGA CCCTGGCCGC CATGTGCTAC AAGTACTCCA TCGGTCAGCC GTTCATGCAG CCGCGTAACG CACTCTCCTA TGCCGGCAAC TTCCTGCACA TGATGTTTGG CGTGCCGACC GAAGAGTACA AGGTCAACCC CATCGTCGAA CGCGCCATGG ACCGCATCTT CACCCTGCAT GCGGACCACG AGCAGAACGC CTCTACCTCG ACCGTGCGTC TGGCCGGCTC CTCCGGCGCC AACCCGTTTG CCTGTATCGC CGCGGGGATC GCCTCCCTGT GGGGACCGGC CCACGGCGGT GCCAACGAAG CCTGCCTCAA GATGCTCGAG GAGATCGGCT CCGTTGACCG CATTCCCGAG TACATCGCCA AGGCCAAGGA CAAGAACGAT CCGTTCCGTC TGATGGGCTT CGGTCACCGG GTCTACAAGA ACCACGATCC CCGTGCCACC GTGATGCGCG AAACCTGTCA CGAGGTACTG ACCGAGCTGC AGATCAAGGA TCCGCTGCTG GACGTGGCCA TGGAGCTGGA GCGCATCGCG CTCTCCGACC CCTACTTCAT CGAGAAGAAG CTCTACCCGA ACGTGGACTT CTACTCCGGC ATCATCATGA AGGCCATCGG CATCCCCATG TCCATGTTCA CCGTGATCTT CGCCATCTCC CGTACCATCG GCTGGATTGC CCACT

Translation


          S  A  F  Q  D  A  D  P  G  R  H  V  L  Q  V  L  H  R  S  A  V  H  A  A  A  *  R  T  L  L  C  R  Q  L   F1
           L  L  S  K  M  P  T  L  A  A  M  C  Y  K  Y  S  I  G  Q  P  F  M  Q  P  R  N  A  L  S  Y  A  G  N     F2
            C  F  P  R  C  R  P  W  P  P  C  A  T  S  T  P  S  V  S  R  S  C  S  R  V  T  H  S  P  M  P  A  T    F3
        1 TCTGCTTTCCAAGATGCCGACCCTGGCCGCCATGTGCTACAAGTACTCCATCGGTCAGCCGTTCATGCAGCCGCGTAACGCACTCTCCTATGCCGGCAAC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            P  A  H  D  V  W  R  A  D  R  R  V  Q  G  Q  P  H  R  R  T  R  H  G  P  H  L  H  P  A  C  G  P  R    F1
          F  L  H  M  M  F  G  V  P  T  E  E  Y  K  V  N  P  I  V  E  R  A  M  D  R  I  F  T  L  H  A  D  H  E   F2
           S  C  T  *  C  L  A  C  R  P  K  S  T  R  S  T  P  S  S  N  A  P  W  T  A  S  S  P  C  M  R  T  T     F3
      101 TTCCTGCACATGATGTTTGGCGTGCCGACCGAAGAGTACAAGGTCAACCCCATCGTCGAACGCGCCATGGACCGCATCTTCACCCTGCATGCGGACCACG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  E  R  L  Y  L  D  R  A  S  G  R  L  L  R  R  Q  P  V  C  L  Y  R  R  G  D  R  L  P  V  G  T  G     F1
            Q  N  A  S  T  S  T  V  R  L  A  G  S  S  G  A  N  P  F  A  C  I  A  A  G  I  A  S  L  W  G  P  A    F2
          S  R  T  P  L  P  R  P  C  V  W  P  A  P  P  A  P  T  R  L  P  V  S  P  R  G  S  P  P  C  G  D  R  P   F3
      201 AGCAGAACGCCTCTACCTCGACCGTGCGTCTGGCCGGCTCCTCCGGCGCCAACCCGTTTGCCTGTATCGCCGCGGGGATCGCCTCCCTGTGGGGACCGGC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  R  R  C  Q  R  S  L  P  Q  D  A  R  G  D  R  L  R  *  P  H  S  R  V  H  R  Q  G  Q  G  Q  E  R  S   F1
           H  G  G  A  N  E  A  C  L  K  M  L  E  E  I  G  S  V  D  R  I  P  E  Y  I  A  K  A  K  D  K  N  D     F2
            T  A  V  P  T  K  P  A  S  R  C  S  R  R  S  A  P  L  T  A  F  P  S  T  S  P  R  P  R  T  R  T  I    F3
      301 CCACGGCGGTGCCAACGAAGCCTGCCTCAAGATGCTCGAGGAGATCGGCTCCGTTGACCGCATTCCCGAGTACATCGCCAAGGCCAAGGACAAGAACGAT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            V  P  S  D  G  L  R  S  P  G  L  Q  E  P  R  S  P  C  H  R  D  A  R  N  L  S  R  G  T  D  R  A  A    F1
          P  F  R  L  M  G  F  G  H  R  V  Y  K  N  H  D  P  R  A  T  V  M  R  E  T  C  H  E  V  L  T  E  L  Q   F2
           R  S  V  *  W  A  S  V  T  G  S  T  R  T  T  I  P  V  P  P  *  C  A  K  P  V  T  R  Y  *  P  S  C     F3
      401 CCGTTCCGTCTGATGGGCTTCGGTCACCGGGTCTACAAGAACCACGATCCCCGTGCCACCGTGATGCGCGAAACCTGTCACGAGGTACTGACCGAGCTGC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           D  Q  G  S  A  A  G  R  G  H  G  A  G  A  H  R  A  L  R  P  L  L  H  R  E  E  A  L  P  E  R  G  L     F1
            I  K  D  P  L  L  D  V  A  M  E  L  E  R  I  A  L  S  D  P  Y  F  I  E  K  K  L  Y  P  N  V  D  F    F2
          R  S  R  I  R  C  W  T  W  P  W  S  W  S  A  S  R  S  P  T  P  T  S  S  R  R  S  S  T  R  T  W  T  S   F3
      501 AGATCAAGGATCCGCTGCTGGACGTGGCCATGGAGCTGGAGCGCATCGCGCTCTCCGACCCCTACTTCATCGAGAAGAAGCTCTACCCGAACGTGGACTT 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          L  L  R  H  H  H  E  G  H  R  H  P  H  V  H  V  H  R  D  L  R  H  L  P  Y  H  R  L  D  C  P  L         F1
           Y  S  G  I  I  M  K  A  I  G  I  P  M  S  M  F  T  V  I  F  A  I  S  R  T  I  G  W  I  A  H  X        F2
            T  P  A  S  S  *  R  P  S  A  S  P  C  P  C  S  P  *  S  S  P  S  P  V  P  S  A  G  L  P  T          F3
      601 CTACTCCGGCATCATCATGAAGGCCATCGGCATCCCCATGTCCATGTTCACCGTGATCTTCGCCATCTCCCGTACCATCGGCTGGATTGCCCACT 695
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