recA allele sequence: id-717
Contig position
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- yes
- method
- Illumina
Sequence
CTTAGCCCAA CTTCATTTTT ACTCACGATT TCCAGCGGAG ATTGGCATGG ATCAGAACAA ACAGAAGGCA CTGGCGGCTG CGCTGGGTCA GATCGAAAAG CAGTTTGGCA AAGGCTCCAT CATGCGTCTG GGCGACAGCA AGACCATGGA CATCGAAGCC ATCTCCACCG GCTCCCTCTC CCTGGACGTG GCGCTGGGCA TCGGTGGCCT GCCGTGCGGT CGTATCGTCG AGATCTATGG CCCGGAATCT TCCGGTAAAA CCACGCTGAC CCTGCAGGTG ATCGCCGAAG CGCAGAAGAA GGGCAAGACC TGTGCCTTCG TCGATGCGGA GCACGCGCTG GATCCCATCT ATGCCGCCAA GCTGGGTGTC AACGTCGACG ACCTGCTGAT CTCCCAGCCG GATACTGGTG AACAGGCGCT GGAAATCTGC GACATGCTGG TGCGCTCCAA CGCGGTTGAC GTCATCATCG TCGACTCGGT GGCGGCCCTG ACTCCGAAAG CGGAAATCGA AGGCGAGATG GGTGACTCCC ACGTAGGCCT GCAGGCCCGT CTGATGTCCC AGGCGCTGCG CAAGCTGACC GCCAACATCA AGAACGCCAA CTGCCTGTGC ATCTTCATCA ACCAGATCCG GATGAAGATC GGTGTCATGT TCGGCAGCCC GGAGACCACT ACCGGTGGTA ACGCGCTCAA GTTCTACGCC TCCGTCCGTC TGGATATCCG TCGCATCGGC GCCATCAAGG AAGGCGACGA AGTTGTCGGT A
Translation
L S P T S F L L T I S S G D W H G S E Q T E G T G G C A G S D R K A F1
L A Q L H F Y S R F P A E I G M D Q N K Q K A L A A A L G Q I E K F2
* P N F I F T H D F Q R R L A W I R T N R R H W R L R W V R S K S F3
1 CTTAGCCCAACTTCATTTTTACTCACGATTTCCAGCGGAGATTGGCATGGATCAGAACAAACAGAAGGCACTGGCGGCTGCGCTGGGTCAGATCGAAAAG 100
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V W Q R L H H A S G R Q Q D H G H R S H L H R L P L P G R G A G H F1
Q F G K G S I M R L G D S K T M D I E A I S T G S L S L D V A L G I F2
S L A K A P S C V W A T A R P W T S K P S P P A P S P W T W R W A F3
101 CAGTTTGGCAAAGGCTCCATCATGCGTCTGGGCGACAGCAAGACCATGGACATCGAAGCCATCTCCACCGGCTCCCTCTCCCTGGACGTGGCGCTGGGCA 200
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R W P A V R S Y R R D L W P G I F R * N H A D P A G D R R S A E E F1
G G L P C G R I V E I Y G P E S S G K T T L T L Q V I A E A Q K K F2
S V A C R A V V S S R S M A R N L P V K P R * P C R * S P K R R R R F3
201 TCGGTGGCCTGCCGTGCGGTCGTATCGTCGAGATCTATGGCCCGGAATCTTCCGGTAAAACCACGCTGACCCTGCAGGTGATCGCCGAAGCGCAGAAGAA 300
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G Q D L C L R R C G A R A G S H L C R Q A G C Q R R R P A D L P A G F1
G K T C A F V D A E H A L D P I Y A A K L G V N V D D L L I S Q P F2
A R P V P S S M R S T R W I P S M P P S W V S T S T T C * S P S R F3
301 GGGCAAGACCTGTGCCTTCGTCGATGCGGAGCACGCGCTGGATCCCATCTATGCCGCCAAGCTGGGTGTCAACGTCGACGACCTGCTGATCTCCCAGCCG 400
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Y W * T G A G N L R H A G A L Q R G * R H H R R L G G G P D S E S F1
D T G E Q A L E I C D M L V R S N A V D V I I V D S V A A L T P K A F2
I L V N R R W K S A T C W C A P T R L T S S S S T R W R P * L R K F3
401 GATACTGGTGAACAGGCGCTGGAAATCTGCGACATGCTGGTGCGCTCCAACGCGGTTGACGTCATCATCGTCGACTCGGTGGCGGCCCTGACTCCGAAAG 500
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G N R R R D G * L P R R P A G P S D V P G A A Q A D R Q H Q E R Q F1
E I E G E M G D S H V G L Q A R L M S Q A L R K L T A N I K N A N F2
R K S K A R W V T P T * A C R P V * C P R R C A S * P P T S R T P T F3
501 CGGAAATCGAAGGCGAGATGGGTGACTCCCACGTAGGCCTGCAGGCCCGTCTGATGTCCCAGGCGCTGCGCAAGCTGACCGCCAACATCAAGAACGCCAA 600
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L P V H L H Q P D P D E D R C H V R Q P G D H Y R W * R A Q V L R L F1
C L C I F I N Q I R M K I G V M F G S P E T T T G G N A L K F Y A F2
A C A S S S T R S G * R S V S C S A A R R P L P V V T R S S S T P F3
601 CTGCCTGTGCATCTTCATCAACCAGATCCGGATGAAGATCGGTGTCATGTTCGGCAGCCCGGAGACCACTACCGGTGGTAACGCGCTCAAGTTCTACGCC 700
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R P S G Y P S H R R H Q G R R R S C R X F1
S V R L D I R R I G A I K E G D E V V G X F2
P S V W I S V A S A P S R K A T K L S V F3
701 TCCGTCCGTCTGGATATCCGTCGCATCGGCGCCATCAAGGAAGGCGACGAAGTTGTCGGTA 761
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