ppsA allele sequence: id-717
Contig position
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- forward
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- yes
- method
- Illumina
Sequence
CTTCTGGCCG GAGCGGGTGA TCGTGCGGAT GTCGGACTTC AAGTCCAACG AGTACGCCAA CCTGGTGGGC GGCCGTGACT ACGAGCCTCA CGAAGAGAAC CCGATGATCG GTTTTCGTGG CGCGTCGCGT TACATCGCCG ACAGCTTCCG CCCCTGTTTT GCCCTCGAGT GCGAGGCGAT CAAGCGGGTG CGTGACGTCA TGGGGCTGAC CAACGTCGAG GTAATGATCC CCTTCGTGCG CACCGTGGGC GAGGCAGAGC AGGTGATAGA CATCCTGGCC GAGAACGGTC TGCGCCGTGG CGAGCGGGGG CTCAAGGTGA TCATGATGTG CGAGATCCCG AGCAACGCCC TCCTGGCAGA CAAGTTCCTC GAACACGTGG ACGGCTTCTC CATCGGATCC AACGACATGA CCCAGCTGAC GCTCGGGCTT GACAGGGACT CGGGCCTTAT CGCCCACCTG TTCGACGAGC GCAACGAGGC GGTCAAGGCG CTGCTGGCGA TGGCCATTGC CGCCGCCCGC AAGGCGGGCA AGTACGTGGG GATCTGCGGC CAGGGCCCGT CCGATCACCC GGACTTCGCC GCCTGGCTGG TCGAGCAGGG GATTGACTCT GTGTCCCTCA ACCCGGATAC CGTGGTCGAT ACCTGGCTCT ATCTGGCCGA GCAGCACAAG GCGAGTTGAC GCAGGCTGCA CAGTCTCCCA TCAAAATGGC GCCCACTGGC GCCATTTTTC ATGGCCG
Translation
L L A G A G D R A D V G L Q V Q R V R Q P G G R P * L R A S R R E P F1
F W P E R V I V R M S D F K S N E Y A N L V G G R D Y E P H E E N F2
S G R S G * S C G C R T S S P T S T P T W W A A V T T S L T K R T F3
1 CTTCTGGCCGGAGCGGGTGATCGTGCGGATGTCGGACTTCAAGTCCAACGAGTACGCCAACCTGGTGGGCGGCCGTGACTACGAGCCTCACGAAGAGAAC 100
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D D R F S W R V A L H R R Q L P P L F C P R V R G D Q A G A * R H F1
P M I G F R G A S R Y I A D S F R P C F A L E C E A I K R V R D V M F2
R * S V F V A R R V T S P T A S A P V L P S S A R R S S G C V T S F3
101 CCGATGATCGGTTTTCGTGGCGCGTCGCGTTACATCGCCGACAGCTTCCGCCCCTGTTTTGCCCTCGAGTGCGAGGCGATCAAGCGGGTGCGTGACGTCA 200
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G A D Q R R G N D P L R A H R G R G R A G D R H P G R E R S A P W F1
G L T N V E V M I P F V R T V G E A E Q V I D I L A E N G L R R G F2
W G * P T S R * * S P S C A P W A R Q S R * * T S W P R T V C A V A F3
201 TGGGGCTGACCAACGTCGAGGTAATGATCCCCTTCGTGCGCACCGTGGGCGAGGCAGAGCAGGTGATAGACATCCTGGCCGAGAACGGTCTGCGCCGTGG 300
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R A G A Q G D H D V R D P E Q R P P G R Q V P R T R G R L L H R I Q F1
E R G L K V I M M C E I P S N A L L A D K F L E H V D G F S I G S F2
S G G S R * S * C A R S R A T P S W Q T S S S N T W T A S P S D P F3
301 CGAGCGGGGGCTCAAGGTGATCATGATGTGCGAGATCCCGAGCAACGCCCTCCTGGCAGACAAGTTCCTCGAACACGTGGACGGCTTCTCCATCGGATCC 400
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R H D P A D A R A * Q G L G P Y R P P V R R A Q R G G Q G A A G D F1
N D M T Q L T L G L D R D S G L I A H L F D E R N E A V K A L L A M F2
T T * P S * R S G L T G T R A L S P T C S T S A T R R S R R C W R F3
401 AACGACATGACCCAGCTGACGCTCGGGCTTGACAGGGACTCGGGCCTTATCGCCCACCTGTTCGACGAGCGCAACGAGGCGGTCAAGGCGCTGCTGGCGA 500
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G H C R R P Q G G Q V R G D L R P G P V R S P G L R R L A G R A G F1
A I A A A R K A G K Y V G I C G Q G P S D H P D F A A W L V E Q G F2
W P L P P P A R R A S T W G S A A R A R P I T R T S P P G W S S R G F3
501 TGGCCATTGCCGCCGCCCGCAAGGCGGGCAAGTACGTGGGGATCTGCGGCCAGGGCCCGTCCGATCACCCGGACTTCGCCGCCTGGCTGGTCGAGCAGGG 600
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D * L C V P Q P G Y R G R Y L A L S G R A A Q G E L T Q A A Q S P I F1
I D S V S L N P D T V V D T W L Y L A E Q H K A S * R R L H S L P F2
L T L C P S T R I P W S I P G S I W P S S T R R V D A G C T V S H F3
601 GATTGACTCTGTGTCCCTCAACCCGGATACCGTGGTCGATACCTGGCTCTATCTGGCCGAGCAGCACAAGGCGAGTTGACGCAGGCTGCACAGTCTCCCA 700
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K M A P T G A I F H G R F1
S K W R P L A P F F M A X F2
Q N G A H W R H F S W P F3
701 TCAAAATGGCGCCCACTGGCGCCATTTTTCATGGCCG 737
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