metG allele sequence: id-717

Contig position

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1044
contig length
236869
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129632
end
130135
length
504
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

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Translation


          R  L  Y  G  N  *  S  S  Y  N  A  G  N  L  R  P  S  L  C  Q  W  L  H  P  S  W  P  H  A  G  T  H  P  G   F1
           D  Y  M  A  T  D  P  R  T  M  L  V  T  C  A  L  P  Y  A  N  G  S  I  H  L  G  H  M  L  E  H  I  Q     F2
            T  I  W  Q  L  I  L  V  Q  C  W  *  P  A  P  F  P  M  P  M  A  P  S  I  L  A  T  C  W  N  T  S  R    F3
        1 CGACTATATGGCAACTGATCCTCGTACAATGCTGGTAACCTGCGCCCTTCCCTATGCCAATGGCTCCATCCATCTTGGCCACATGCTGGAACACATCCAG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  Y  L  G  S  L  S  A  N  A  R  S  P  G  A  L  C  L  C  R  R  C  P  R  H  P  D  H  A  Q  G  P  T    F1
          A  D  I  W  V  R  Y  Q  R  M  R  G  H  Q  V  H  F  V  C  A  D  D  A  H  G  T  P  I  M  L  K  A  Q  Q   F2
           P  I  S  G  F  V  I  S  E  C  A  V  T  R  C  T  L  S  V  P  T  M  P  T  A  P  R  S  C  S  R  P  N     F3
      101 GCCGATATCTGGGTTCGTTATCAGCGAATGCGCGGTCACCAGGTGCACTTTGTCTGTGCCGACGATGCCCACGGCACCCCGATCATGCTCAAGGCCCAAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  G  D  H  P  G  R  D  D  R  G  R  L  Q  G  A  P  G  R  L  R  R  V  Q  H  Q  F  *  Q  L  S  L  H     F1
            L  G  I  T  P  E  E  M  I  A  A  V  S  K  E  H  Q  A  D  F  A  G  F  N  I  S  F  D  N  Y  H  S  T    F2
          S  W  G  S  P  R  K  R  *  S  R  P  S  P  R  S  T  R  P  T  S  P  G  S  T  S  V  L  T  T  I  T  P  P   F3
      201 AGCTGGGGATCACCCCGGAAGAGATGATCGCGGCCGTCTCCAAGGAGCACCAGGCCGACTTCGCCGGGTTCAACATCAGTTTTGACAACTATCACTCCAC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  Q  R  R  E  P  R  A  G  G  A  D  L  R  P  S  A  G  R  R  Q  D  Q  E  P  H  H  L  P  A  V  R  S  *   F1
           H  S  D  E  N  R  E  L  A  E  L  I  Y  G  R  L  Q  A  G  G  K  I  K  S  R  T  I  S  Q  L  F  D  P     F2
            T  A  T  R  T  A  S  W  R  S  *  S  T  A  V  C  R  P  A  A  R  S  R  A  A  P  S  P  S  C  S  I  L    F3
      301 CCACAGCGACGAGAACCGCGAGCTGGCGGAGCTGATCTACGGCCGTCTGCAGGCCGGCGGCAAGATCAAGAGCCGCACCATCTCCCAGCTGTTCGATCCT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            K  V  H  V  P  A  G  S  L  R  Q  G  Y  L  P  Q  V  Q  V  P  G  A  V  W  R  Q  L  R  Q  L  R  R  H    F1
          E  K  S  M  F  L  P  D  R  F  V  K  G  T  C  P  K  C  K  S  P  E  Q  Y  G  D  N  C  D  S  C  G  A  T   F2
           K  S  P  C  S  C  R  I  A  S  S  R  V  P  A  P  S  A  S  P  R  S  S  M  A  T  T  A  T  A  A  A  P     F3
      401 GAAAAGTCCATGTTCCTGCCGGATCGCTTCGTCAAGGGTACCTGCCCCAAGTGCAAGTCCCCGGAGCAGTATGGCGACAACTGCGACAGCTGCGGCGCCA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           L  Q  P  D  R  A  D  *  S  E  I  R  R  L  R  R  H  P  G  D  E  G  L  R  A  L  L  L  R  S  A  A  V     F1
            Y  S  P  T  E  L  I  D  P  K  S  A  V  S  G  A  T  P  V  M  K  D  S  E  H  F  F  F  D  L  P  Q  F    F2
          P  T  A  R  P  S  *  L  I  R  N  P  P  S  P  A  P  P  R  *  *  R  T  P  S  T  S  S  S  I  C  R  S  L   F3
      501 CCTACAGCCCGACCGAGCTGATTGATCCGAAATCCGCCGTCTCCGGCGCCACCCCGGTGATGAAGGACTCCGAGCACTTCTTCTTCGATCTGCCGCAGTT 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          *  K  M  A  G  R  V  G  A  R  L  R  R  H  P  G  R  D  G  Q  Q  D  A  G  V  V  R  K  R  P  A  A  V  G   F1
           E  K  W  L  A  E  W  V  R  G  S  G  A  I  Q  E  E  M  A  N  K  M  Q  E  W  F  E  S  G  L  Q  Q  W     F2
            K  N  G  W  Q  S  G  C  A  A  P  A  P  S  R  K  R  W  P  T  R  C  R  S  G  S  K  A  A  C  S  S  G    F3
      601 TGAAAAATGGCTGGCAGAGTGGGTGCGCGGCTCCGGCGCCATCCAGGAAGAGATGGCCAACAAGATGCAGGAGTGGTTCGAAAGCGGCCTGCAGCAGTGG 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            X                                                                                                    F1
          D  X                                                                                                   F2
           T                                                                                                     F3
      701 GACA 704
          ----