gyrB allele sequence: id-717
Contig position
- sequence bin id
- 1003
- contig length
- 107087
- start
- 61062
- end
- 61538
- length
- 477
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCTGGTGGGC TTCCGTACCG CGCTGACCCG TACTCTGAAC TCCTACATGG ACAAAGAGGA CTACAGCAAG AAGGCCAAGT CTGCCGCCAG TGGCGACGAC GTGCGTGAAG GTCTGATTGC CGTTATCTCC GTCAAGGTGC CTGATCCCAA GTTCTCCTCC CAGACCAAGG ACAAGCTGGT CTCTTCCGAA GTGAAGACCG CCGTCGAACA GGCGATGGGT GAGAAGCTGG CCGACTTCCT GCTGGAAAAC CCGGGCGATG CCAAGATCGT GGTCAACAAG ATCATCGATG CGGCCCGTGC CCGTGAGGCG GCCCGCAAGG CCCGCGAACT GACCCGCCGC AAAGGCGCGC TGGATATCGC CGGTCTGCCC GGCAAGCTGG CTGACTGTCA GGAAAAAGAC CCGGCGCTCT CCGAACTCTA CATAGTGGAA GGGGACTCTG CTGGCGGTTC CGCCAAGCAG GGTCGCAACC GGAAGAACCA GGCCATCCTG CCGCTCAAGG GCAAGATCCT GAACGTGGAG AAGGCCCGTT TCGACAAGAT GATCTCCTCC CAGGAGGTGG GCACCCTGAT CACCGCACTG GGTTGCGGTA TCGGTCGCGA CGAGTACAAC CCGGACAAGC TGCGTTACCA CAACATCATC ATCATGACCG ATGCGGACGT CGATGGTGCG CACATTC
Translation
P G G L P Y R A D P Y S E L L H G Q R G L Q Q E G Q V C R Q W R R R F1
L V G F R T A L T R T L N S Y M D K E D Y S K K A K S A A S G D D F2
W W A S V P R * P V L * T P T W T K R T T A R R P S L P P V A T T F3
1 CCTGGTGGGCTTCCGTACCGCGCTGACCCGTACTCTGAACTCCTACATGGACAAAGAGGACTACAGCAAGAAGGCCAAGTCTGCCGCCAGTGGCGACGAC 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A * R S D C R Y L R Q G A * S Q V L L P D Q G Q A G L F R S E D R F1
V R E G L I A V I S V K V P D P K F S S Q T K D K L V S S E V K T A F2
C V K V * L P L S P S R C L I P S S P P R P R T S W S L P K * R P F3
101 GTGCGTGAAGGTCTGATTGCCGTTATCTCCGTCAAGGTGCCTGATCCCAAGTTCTCCTCCCAGACCAAGGACAAGCTGGTCTCTTCCGAAGTGAAGACCG 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R R T G D G * E A G R L P A G K P G R C Q D R G Q Q D H R C G P C F1
V E Q A M G E K L A D F L L E N P G D A K I V V N K I I D A A R A F2
P S N R R W V R S W P T S C W K T R A M P R S W S T R S S M R P V P F3
201 CCGTCGAACAGGCGATGGGTGAGAAGCTGGCCGACTTCCTGCTGGAAAACCCGGGCGATGCCAAGATCGTGGTCAACAAGATCATCGATGCGGCCCGTGC 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
P * G G P Q G P R T D P P Q R R A G Y R R S A R Q A G * L S G K R P F1
R E A A R K A R E L T R R K G A L D I A G L P G K L A D C Q E K D F2
V R R P A R P A N * P A A K A R W I S P V C P A S W L T V R K K T F3
301 CCGTGAGGCGGCCCGCAAGGCCCGCGAACTGACCCGCCGCAAAGGCGCGCTGGATATCGCCGGTCTGCCCGGCAAGCTGGCTGACTGTCAGGAAAAAGAC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G A L R T L H S G R G L C W R F R Q A G S Q P E E P G H P A A Q G F1
P A L S E L Y I V E G D S A G G S A K Q G R N R K N Q A I L P L K G F2
R R S P N S T * W K G T L L A V P P S R V A T G R T R P S C R S R F3
401 CCGGCGCTCTCCGAACTCTACATAGTGGAAGGGGACTCTGCTGGCGGTTCCGCCAAGCAGGGTCGCAACCGGAAGAACCAGGCCATCCTGCCGCTCAAGG 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
Q D P E R G E G P F R Q D D L L P G G G H P D H R T G L R Y R S R F1
K I L N V E K A R F D K M I S S Q E V G T L I T A L G C G I G R D F2
A R S * T W R R P V S T R * S P P R R W A P * S P H W V A V S V A T F3
501 GCAAGATCCTGAACGTGGAGAAGGCCCGTTTCGACAAGATGATCTCCTCCCAGGAGGTGGGCACCCTGATCACCGCACTGGGTTGCGGTATCGGTCGCGA 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R V Q P G Q A A L P Q H H H H D R C G R R W C A H S F1
E Y N P D K L R Y H N I I I M T D A D V D G A H I X F2
S T T R T S C V T T T S S S * P M R T S M V R T F F3
601 CGAGTACAACCCGGACAAGCTGCGTTACCACAACATCATCATCATGACCGATGCGGACGTCGATGGTGCGCACATTC 677
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:--