gltA allele sequence: id-717

Contig position

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1077
contig length
139173
start
4929
end
5423
length
495
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

TCTGCTCTCC AAGATGCCGA CCCTGGCCGC CATGTGCTAC AAGTACTCCA TCGGTCAGCC GTTCATGCAG CCGCGTAACG CCCTCTCCTA TGCCGGCAAC TTCCTGCACA TGATGTTTGG CGTGCCGACC GAAGAGTACA AGGTCAACCC CATCGTCGAA CGCGCCATGG ATCGCATCTT CACCCTGCAT GCGGACCACG AGCAGAACGC CTCCACCTCC ACCGTGCGTC TGGCCGGCTC CTCCGGCGCC AACCCGTTTG CCTGTATCGC CGCGGGGATC GCCTCCCTGT GGGGACCGGC CCACGGCGGT GCCAACGAAG CCTGCCTCAA GATGCTCGAG GAGATCGGCT CCGTTGACCG TATCCCCGAA TACATCGCCA AGGCCAAGGA CAAGAACGAT CCGTTCCGTC TGATGGGCTT CGGTCACCGG GTCTACAAGA ACCACGACCC CCGTGCCACC GTGATGCGCG AAACCTGTCA CGAGGTACTG ACCGAGCTGC AGATCAAGGA TCCGCTGCTG GACGTGGCCA TGGAGCTGGA ACGCATCGCG CTCTCCGACC CCTACTTCAT CGAGAAGAAG CTCTACCCGA ACGTGGACTT CTACTCCGGC ATCATCATGA AGGCCATCGG CATCCCCATG TCCATGTTCA CCGTGATCTT CGCCATCTCC CGTACCATCG GCTGGATTGC CCACT

Translation


          S  A  L  Q  D  A  D  P  G  R  H  V  L  Q  V  L  H  R  S  A  V  H  A  A  A  *  R  P  L  L  C  R  Q  L   F1
           L  L  S  K  M  P  T  L  A  A  M  C  Y  K  Y  S  I  G  Q  P  F  M  Q  P  R  N  A  L  S  Y  A  G  N     F2
            C  S  P  R  C  R  P  W  P  P  C  A  T  S  T  P  S  V  S  R  S  C  S  R  V  T  P  S  P  M  P  A  T    F3
        1 TCTGCTCTCCAAGATGCCGACCCTGGCCGCCATGTGCTACAAGTACTCCATCGGTCAGCCGTTCATGCAGCCGCGTAACGCCCTCTCCTATGCCGGCAAC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            P  A  H  D  V  W  R  A  D  R  R  V  Q  G  Q  P  H  R  R  T  R  H  G  S  H  L  H  P  A  C  G  P  R    F1
          F  L  H  M  M  F  G  V  P  T  E  E  Y  K  V  N  P  I  V  E  R  A  M  D  R  I  F  T  L  H  A  D  H  E   F2
           S  C  T  *  C  L  A  C  R  P  K  S  T  R  S  T  P  S  S  N  A  P  W  I  A  S  S  P  C  M  R  T  T     F3
      101 TTCCTGCACATGATGTTTGGCGTGCCGACCGAAGAGTACAAGGTCAACCCCATCGTCGAACGCGCCATGGATCGCATCTTCACCCTGCATGCGGACCACG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  E  R  L  H  L  H  R  A  S  G  R  L  L  R  R  Q  P  V  C  L  Y  R  R  G  D  R  L  P  V  G  T  G     F1
            Q  N  A  S  T  S  T  V  R  L  A  G  S  S  G  A  N  P  F  A  C  I  A  A  G  I  A  S  L  W  G  P  A    F2
          S  R  T  P  P  P  P  P  C  V  W  P  A  P  P  A  P  T  R  L  P  V  S  P  R  G  S  P  P  C  G  D  R  P   F3
      201 AGCAGAACGCCTCCACCTCCACCGTGCGTCTGGCCGGCTCCTCCGGCGCCAACCCGTTTGCCTGTATCGCCGCGGGGATCGCCTCCCTGTGGGGACCGGC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  R  R  C  Q  R  S  L  P  Q  D  A  R  G  D  R  L  R  *  P  Y  P  R  I  H  R  Q  G  Q  G  Q  E  R  S   F1
           H  G  G  A  N  E  A  C  L  K  M  L  E  E  I  G  S  V  D  R  I  P  E  Y  I  A  K  A  K  D  K  N  D     F2
            T  A  V  P  T  K  P  A  S  R  C  S  R  R  S  A  P  L  T  V  S  P  N  T  S  P  R  P  R  T  R  T  I    F3
      301 CCACGGCGGTGCCAACGAAGCCTGCCTCAAGATGCTCGAGGAGATCGGCTCCGTTGACCGTATCCCCGAATACATCGCCAAGGCCAAGGACAAGAACGAT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            V  P  S  D  G  L  R  S  P  G  L  Q  E  P  R  P  P  C  H  R  D  A  R  N  L  S  R  G  T  D  R  A  A    F1
          P  F  R  L  M  G  F  G  H  R  V  Y  K  N  H  D  P  R  A  T  V  M  R  E  T  C  H  E  V  L  T  E  L  Q   F2
           R  S  V  *  W  A  S  V  T  G  S  T  R  T  T  T  P  V  P  P  *  C  A  K  P  V  T  R  Y  *  P  S  C     F3
      401 CCGTTCCGTCTGATGGGCTTCGGTCACCGGGTCTACAAGAACCACGACCCCCGTGCCACCGTGATGCGCGAAACCTGTCACGAGGTACTGACCGAGCTGC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           D  Q  G  S  A  A  G  R  G  H  G  A  G  T  H  R  A  L  R  P  L  L  H  R  E  E  A  L  P  E  R  G  L     F1
            I  K  D  P  L  L  D  V  A  M  E  L  E  R  I  A  L  S  D  P  Y  F  I  E  K  K  L  Y  P  N  V  D  F    F2
          R  S  R  I  R  C  W  T  W  P  W  S  W  N  A  S  R  S  P  T  P  T  S  S  R  R  S  S  T  R  T  W  T  S   F3
      501 AGATCAAGGATCCGCTGCTGGACGTGGCCATGGAGCTGGAACGCATCGCGCTCTCCGACCCCTACTTCATCGAGAAGAAGCTCTACCCGAACGTGGACTT 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          L  L  R  H  H  H  E  G  H  R  H  P  H  V  H  V  H  R  D  L  R  H  L  P  Y  H  R  L  D  C  P  L         F1
           Y  S  G  I  I  M  K  A  I  G  I  P  M  S  M  F  T  V  I  F  A  I  S  R  T  I  G  W  I  A  H  X        F2
            T  P  A  S  S  *  R  P  S  A  S  P  C  P  C  S  P  *  S  S  P  S  P  V  P  S  A  G  L  P  T          F3
      601 CTACTCCGGCATCATCATGAAGGCCATCGGCATCCCCATGTCCATGTTCACCGTGATCTTCGCCATCTCCCGTACCATCGGCTGGATTGCCCACT 695
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