ppsA allele sequence: id-714
Contig position
- sequence bin id
- 637
- contig length
- 320606
- start
- 42163
- end
- 42699
- length
- 537
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CTTCTGGCCG GAGCGGGTGA TTGTGCGGAT GTCGGACTTC AAGTCCAACG AGTACGCCAA CCTGGTGGGT GGCCGTGACT ACGAGCCTCA CGAAGAGAAC CCGATGATCG GTTTCCGCGG TGCGTCGCGC TACATCGCCG ACAGCTTCCG CCCCTGTTTT GCCCTCGAGT GCGAGGCGAT CAAGCGGGTG CGCGATGTGA TGGGGCTGAC CAACGTCGAG GTGATGATCC CCTTCGTGCG CACCGTAGGC GAGGCGGAGC AGGTGATCGA CATCCTGGCA GAGAACGGTC TGCGCCGTGG CGAGCGGGGG CTCAAGGTGA TCATGATGTG CGAGATCCCG AGCAACGCCC TCTTGGCAGA CAAGTTCCTC GAGCACGTGG ACGGCTTCTC CATCGGCTCC AACGACATGA CCCAGCTCAC CCTTGGACTT GATAGGGACT CGGGGCTTAT CGCACACCTG TTCGACGAGC GAAACGAAGC GGTCAAGGCG CTGCTGGCGA TGGCCATTGC TGCCGCCCGC AAGGCGGGCA AGTACGTGGG GATCTGCGGC CAGGGGCCGT CCGATCATCC GGACTTTGCC GCCTGGCTGG TCGAGCAGGG CATAGACTCT GTGTCGCTCA ACCCGGATAC CGTGGTCGAC ACCTGGCTCT ATCTGGCCGA GCAGCACAAG GCGAGTTGAC GCCGGCTGCA CAGCCCCCCA CCAAAATGGC GCCCACGGGC GCCATTTTTC ATGACTG
Translation
L L A G A G D C A D V G L Q V Q R V R Q P G G W P * L R A S R R E P F1
F W P E R V I V R M S D F K S N E Y A N L V G G R D Y E P H E E N F2
S G R S G * L C G C R T S S P T S T P T W W V A V T T S L T K R T F3
1 CTTCTGGCCGGAGCGGGTGATTGTGCGGATGTCGGACTTCAAGTCCAACGAGTACGCCAACCTGGTGGGTGGCCGTGACTACGAGCCTCACGAAGAGAAC 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
D D R F P R C V A L H R R Q L P P L F C P R V R G D Q A G A R C D F1
P M I G F R G A S R Y I A D S F R P C F A L E C E A I K R V R D V M F2
R * S V S A V R R A T S P T A S A P V L P S S A R R S S G C A M * F3
101 CCGATGATCGGTTTCCGCGGTGCGTCGCGCTACATCGCCGACAGCTTCCGCCCCTGTTTTGCCCTCGAGTGCGAGGCGATCAAGCGGGTGCGCGATGTGA 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G A D Q R R G D D P L R A H R R R G G A G D R H P G R E R S A P W F1
G L T N V E V M I P F V R T V G E A E Q V I D I L A E N G L R R G F2
W G * P T S R * * S P S C A P * A R R S R * S T S W Q R T V C A V A F3
201 TGGGGCTGACCAACGTCGAGGTGATGATCCCCTTCGTGCGCACCGTAGGCGAGGCGGAGCAGGTGATCGACATCCTGGCAGAGAACGGTCTGCGCCGTGG 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R A G A Q G D H D V R D P E Q R P L G R Q V P R A R G R L L H R L Q F1
E R G L K V I M M C E I P S N A L L A D K F L E H V D G F S I G S F2
S G G S R * S * C A R S R A T P S W Q T S S S S T W T A S P S A P F3
301 CGAGCGGGGGCTCAAGGTGATCATGATGTGCGAGATCCCGAGCAACGCCCTCTTGGCAGACAAGTTCCTCGAGCACGTGGACGGCTTCTCCATCGGCTCC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R H D P A H P W T * * G L G A Y R T P V R R A K R S G Q G A A G D F1
N D M T Q L T L G L D R D S G L I A H L F D E R N E A V K A L L A M F2
T T * P S S P L D L I G T R G L S H T C S T S E T K R S R R C W R F3
401 AACGACATGACCCAGCTCACCCTTGGACTTGATAGGGACTCGGGGCTTATCGCACACCTGTTCGACGAGCGAAACGAAGCGGTCAAGGCGCTGCTGGCGA 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G H C C R P Q G G Q V R G D L R P G A V R S S G L C R L A G R A G F1
A I A A A R K A G K Y V G I C G Q G P S D H P D F A A W L V E Q G F2
W P L L P P A R R A S T W G S A A R G R P I I R T L P P G W S S R A F3
501 TGGCCATTGCTGCCGCCCGCAAGGCGGGCAAGTACGTGGGGATCTGCGGCCAGGGGCCGTCCGATCATCCGGACTTTGCCGCCTGGCTGGTCGAGCAGGG 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
H R L C V A Q P G Y R G R H L A L S G R A A Q G E L T P A A Q P P T F1
I D S V S L N P D T V V D T W L Y L A E Q H K A S * R R L H S P P F2
* T L C R S T R I P W S T P G S I W P S S T R R V D A G C T A P H F3
601 CATAGACTCTGTGTCGCTCAACCCGGATACCGTGGTCGACACCTGGCTCTATCTGGCCGAGCAGCACAAGGCGAGTTGACGCCGGCTGCACAGCCCCCCA 700
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
K M A P T G A I F H D X F1
P K W R P R A P F F M T X F2
Q N G A H G R H F S * L F3
701 CCAAAATGGCGCCCACGGGCGCCATTTTTCATGACTG 737
----:----|----:----|----:----|----:--