gyrB allele sequence: id-714
Contig position
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- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCTGGTGGGC TTCCGTACCG CGCTGACCCG TACTCTGAAC TCCTACATGG ACAAAGAGGA CTACAGCAAG AAGGCCAAGT CTGCCGCCAG TGGCGACGAC GTGCGTGAAG GTCTGATTGC CGTTATCTCC GTCAAGGTGC CGGATCCCAA GTTCTCCTCC CAGACCAAGG ACAAGCTGGT CTCTTCCGAA GTGAAGACCG CCGTCGAACA GGCGATGGGT GAGAAGCTGG CCGACTTCCT GCTGGAAAAC CCGGGCGATG CCAAGATCGT GGTCAACAAG ATCATCGATG CGGCCCGTGC CCGCGAAGCG GCCCGCAAGG CCCGCGAACT GACTCGCCGT AAAGGCGCGC TGGATATCGC CGGTCTGCCC GGCAAGCTGG CCGACTGTCA GGAAAAAGAC CCGGCGCTCT CCGAACTCTA CATAGTGGAA GGGGACTCTG CTGGCGGTTC CGCCAAGCAG GGTCGCAACC GGAAGAACCA GGCCATCCTG CCGCTCAAGG GCAAGATCCT GAACGTGGAG AAGGCCCGTT TCGACAAGAT GATCTCCTCC CAGGAGGTGG GCACCCTGAT CACCGCACTG GGCTGCGGCA TCGGTCGTGA CGAGTACAAC CCGGACAAGC TGCGTTATCA CAACATCATC ATCATGACCG ATGCGGACGT CGATGGTGCA CACATCC
Translation
P G G L P Y R A D P Y S E L L H G Q R G L Q Q E G Q V C R Q W R R R F1
L V G F R T A L T R T L N S Y M D K E D Y S K K A K S A A S G D D F2
W W A S V P R * P V L * T P T W T K R T T A R R P S L P P V A T T F3
1 CCTGGTGGGCTTCCGTACCGCGCTGACCCGTACTCTGAACTCCTACATGGACAAAGAGGACTACAGCAAGAAGGCCAAGTCTGCCGCCAGTGGCGACGAC 100
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A * R S D C R Y L R Q G A G S Q V L L P D Q G Q A G L F R S E D R F1
V R E G L I A V I S V K V P D P K F S S Q T K D K L V S S E V K T A F2
C V K V * L P L S P S R C R I P S S P P R P R T S W S L P K * R P F3
101 GTGCGTGAAGGTCTGATTGCCGTTATCTCCGTCAAGGTGCCGGATCCCAAGTTCTCCTCCCAGACCAAGGACAAGCTGGTCTCTTCCGAAGTGAAGACCG 200
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R R T G D G * E A G R L P A G K P G R C Q D R G Q Q D H R C G P C F1
V E Q A M G E K L A D F L L E N P G D A K I V V N K I I D A A R A F2
P S N R R W V R S W P T S C W K T R A M P R S W S T R S S M R P V P F3
201 CCGTCGAACAGGCGATGGGTGAGAAGCTGGCCGACTTCCTGCTGGAAAACCCGGGCGATGCCAAGATCGTGGTCAACAAGATCATCGATGCGGCCCGTGC 300
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P R S G P Q G P R T D S P * R R A G Y R R S A R Q A G R L S G K R P F1
R E A A R K A R E L T R R K G A L D I A G L P G K L A D C Q E K D F2
A K R P A R P A N * L A V K A R W I S P V C P A S W P T V R K K T F3
301 CCGCGAAGCGGCCCGCAAGGCCCGCGAACTGACTCGCCGTAAAGGCGCGCTGGATATCGCCGGTCTGCCCGGCAAGCTGGCCGACTGTCAGGAAAAAGAC 400
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G A L R T L H S G R G L C W R F R Q A G S Q P E E P G H P A A Q G F1
P A L S E L Y I V E G D S A G G S A K Q G R N R K N Q A I L P L K G F2
R R S P N S T * W K G T L L A V P P S R V A T G R T R P S C R S R F3
401 CCGGCGCTCTCCGAACTCTACATAGTGGAAGGGGACTCTGCTGGCGGTTCCGCCAAGCAGGGTCGCAACCGGAAGAACCAGGCCATCCTGCCGCTCAAGG 500
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Q D P E R G E G P F R Q D D L L P G G G H P D H R T G L R H R S * F1
K I L N V E K A R F D K M I S S Q E V G T L I T A L G C G I G R D F2
A R S * T W R R P V S T R * S P P R R W A P * S P H W A A A S V V T F3
501 GCAAGATCCTGAACGTGGAGAAGGCCCGTTTCGACAAGATGATCTCCTCCCAGGAGGTGGGCACCCTGATCACCGCACTGGGCTGCGGCATCGGTCGTGA 600
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R V Q P G Q A A L S Q H H H H D R C G R R W C T H P F1
E Y N P D K L R Y H N I I I M T D A D V D G A H I X F2
S T T R T S C V I T T S S S * P M R T S M V H T S F3
601 CGAGTACAACCCGGACAAGCTGCGTTATCACAACATCATCATCATGACCGATGCGGACGTCGATGGTGCACACATCC 677
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