groL allele sequence: id-714

Contig position

sequence bin id
544
contig length
123993
start
115684
end
116193
length
510
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

CGGTACCACT ACCGCTACCG TACTGGCTCA AGCCATCGTC AACGAAGGCC TGAAGGCCGT TGCCGCCGGC ATGAACCCGA TGGATCTGAA GCGTGGTATC GACAAGGCCG TAGTAGCCGC CGTTGCCGAG CTGCAAGCGC TGTCCCAGCC GTGTGCCGAC AACAATGCCA TCGCTCAGGT CGGCACCATC TCCGCCAACT CCGACGAGAA AGTCGGCAAG CTGATTGCCG AAGCCATGGA TAAAGTAGGT CGTGACGGCG TCATCACCGT TGAAGACGGC CAGGGTCTGG ACGACGAGCT GGCCGTGGTA GAAGGCATGC AGTTCGACCG TGGCTACCTC TCCCCGTACT TCGTCAACAA GCCGGAAACC GGTGCTGTTG AGCTGGACGA TCCCTTCATC CTGCTGGTTG ACAAGAAAGT CTCCAACATC CGTGAAATGC TGCCGGTGCT GGAAGGCGTA GCCAAAGCAG GCAAACCGCT GATCATCGTA GCCGAAGATG TAGAAGGCGA AGCGCTGGCG ACCTTGGTGG TCAACACCAT GCGTGGCATC GTAAAAGTTG CTGCCGTCAA GGCGCCTGGC TTCGGTGACC GTCGCAAGGC CATGCTGCAG GATATCGCCA TCCTGACCGG TGGTACCGTG ATCTCCGAAG AAGTGGGCAT GGAGCTGGAA AAAGCGACCC TGGAAGACCT GGGCCGTGCC AAGCGCATCG

Translation


          R  Y  H  Y  R  Y  R  T  G  S  S  H  R  Q  R  R  P  E  G  R  C  R  R  H  E  P  D  G  S  E  A  W  Y  R   F1
           G  T  T  T  A  T  V  L  A  Q  A  I  V  N  E  G  L  K  A  V  A  A  G  M  N  P  M  D  L  K  R  G  I     F2
            V  P  L  P  L  P  Y  W  L  K  P  S  S  T  K  A  *  R  P  L  P  P  A  *  T  R  W  I  *  S  V  V  S    F3
        1 CGGTACCACTACCGCTACCGTACTGGCTCAAGCCATCGTCAACGAAGGCCTGAAGGCCGTTGCCGCCGGCATGAACCCGATGGATCTGAAGCGTGGTATC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            Q  G  R  S  S  R  R  C  R  A  A  S  A  V  P  A  V  C  R  Q  Q  C  H  R  S  G  R  H  H  L  R  Q  L    F1
          D  K  A  V  V  A  A  V  A  E  L  Q  A  L  S  Q  P  C  A  D  N  N  A  I  A  Q  V  G  T  I  S  A  N  S   F2
           T  R  P  *  *  P  P  L  P  S  C  K  R  C  P  S  R  V  P  T  T  M  P  S  L  R  S  A  P  S  P  P  T     F3
      101 GACAAGGCCGTAGTAGCCGCCGTTGCCGAGCTGCAAGCGCTGTCCCAGCCGTGTGCCGACAACAATGCCATCGCTCAGGTCGGCACCATCTCCGCCAACT 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  R  E  S  R  Q  A  D  C  R  S  H  G  *  S  R  S  *  R  R  H  H  R  *  R  R  P  G  S  G  R  R  A     F1
            D  E  K  V  G  K  L  I  A  E  A  M  D  K  V  G  R  D  G  V  I  T  V  E  D  G  Q  G  L  D  D  E  L    F2
          P  T  R  K  S  A  S  *  L  P  K  P  W  I  K  *  V  V  T  A  S  S  P  L  K  T  A  R  V  W  T  T  S  W   F3
      201 CCGACGAGAAAGTCGGCAAGCTGATTGCCGAAGCCATGGATAAAGTAGGTCGTGACGGCGTCATCACCGTTGAAGACGGCCAGGGTCTGGACGACGAGCT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  R  G  R  R  H  A  V  R  P  W  L  P  L  P  V  L  R  Q  Q  A  G  N  R  C  C  *  A  G  R  S  L  H  P   F1
           A  V  V  E  G  M  Q  F  D  R  G  Y  L  S  P  Y  F  V  N  K  P  E  T  G  A  V  E  L  D  D  P  F  I     F2
            P  W  *  K  A  C  S  S  T  V  A  T  S  P  R  T  S  S  T  S  R  K  P  V  L  L  S  W  T  I  P  S  S    F3
      301 GGCCGTGGTAGAAGGCATGCAGTTCGACCGTGGCTACCTCTCCCCGTACTTCGTCAACAAGCCGGAAACCGGTGCTGTTGAGCTGGACGATCCCTTCATC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  G  *  Q  E  S  L  Q  H  P  *  N  A  A  G  A  G  R  R  S  Q  S  R  Q  T  A  D  H  R  S  R  R  C    F1
          L  L  V  D  K  K  V  S  N  I  R  E  M  L  P  V  L  E  G  V  A  K  A  G  K  P  L  I  I  V  A  E  D  V   F2
           C  W  L  T  R  K  S  P  T  S  V  K  C  C  R  C  W  K  A  *  P  K  Q  A  N  R  *  S  S  *  P  K  M     F3
      401 CTGCTGGTTGACAAGAAAGTCTCCAACATCCGTGAAATGCTGCCGGTGCTGGAAGGCGTAGCCAAAGCAGGCAAACCGCTGATCATCGTAGCCGAAGATG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  R  R  S  A  G  D  L  G  G  Q  H  H  A  W  H  R  K  S  C  C  R  Q  G  A  W  L  R  *  P  S  Q  G     F1
            E  G  E  A  L  A  T  L  V  V  N  T  M  R  G  I  V  K  V  A  A  V  K  A  P  G  F  G  D  R  R  K  A    F2
          *  K  A  K  R  W  R  P  W  W  S  T  P  C  V  A  S  *  K  L  L  P  S  R  R  L  A  S  V  T  V  A  R  P   F3
      501 TAGAAGGCGAAGCGCTGGCGACCTTGGTGGTCAACACCATGCGTGGCATCGTAAAAGTTGCTGCCGTCAAGGCGCCTGGCTTCGGTGACCGTCGCAAGGC 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          H  A  A  G  Y  R  H  P  D  R  W  Y  R  D  L  R  R  S  G  H  G  A  G  K  S  D  P  G  R  P  G  P  C  Q   F1
           M  L  Q  D  I  A  I  L  T  G  G  T  V  I  S  E  E  V  G  M  E  L  E  K  A  T  L  E  D  L  G  R  A     F2
            C  C  R  I  S  P  S  *  P  V  V  P  *  S  P  K  K  W  A  W  S  W  K  K  R  P  W  K  T  W  A  V  P    F3
      601 CATGCTGCAGGATATCGCCATCCTGACCGGTGGTACCGTGATCTCCGAAGAAGTGGGCATGGAGCTGGAAAAAGCGACCCTGGAAGACCTGGGCCGTGCC 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  H  R                                                                                              F1
          K  R  I  X                                                                                             F2
           S  A  S                                                                                               F3
      701 AAGCGCATCG 710
          ----:----|