gltA allele sequence: id-714

Contig position

sequence bin id
642
contig length
156575
start
125479
end
125973
length
495
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

TCTGCTCTCC AAGATGCCGA CCCTGGCCGC CATGTGCTAC AAGTACTCCA TCGGTCAGCC GTTCATGCAG CCGCGTAACG CCCTCTCCTA TGCCGGCAAC TTCCTGCACA TGATGTTTGG CGTGCCGACC GAAGAGTACA AGGTCAACCC CATCGTCGAA CGCGCCATGG ACCGCATCTT CACCCTGCAT GCGGACCACG AGCAGAACGC CTCCACCTCC ACCGTGCGTC TGGCCGGCTC CTCCGGCGCC AACCCGTTTG CCTGTATCGC CGCGGGGATC GCCTCCCTGT GGGGACCGGC CCACGGCGGT GCCAACGAAG CCTGCCTCAA GATGCTCGAG GAGATCGGCT CCGTTGATCG CATTCCCGAG TACATCGCCA AGGCCAAGGA CAAGAACGAT CCGTTCCGTC TGATGGGCTT CGGCCACCGG GTCTACAAGA ACCACGACCC CCGTGCCACC GTGATGCGCG AAACCTGCCA CGAGGTACTG ACCGAGCTGC AGATCAAGGA TCCGCTGCTG GACGTGGCCA TGGAGCTGGA GCGCATCGCG CTCTCCGACC CCTACTTCAT CGAGAAGAAG CTCTACCCGA ACGTGGACTT CTACTCCGGC ATCATCATGA AGGCCATCGG CATCCCCATG TCCATGTTCA CCGTGATCTT CGCCATCTCC CGTACCATCG GCTGGATTGC CCACT

Translation


          S  A  L  Q  D  A  D  P  G  R  H  V  L  Q  V  L  H  R  S  A  V  H  A  A  A  *  R  P  L  L  C  R  Q  L   F1
           L  L  S  K  M  P  T  L  A  A  M  C  Y  K  Y  S  I  G  Q  P  F  M  Q  P  R  N  A  L  S  Y  A  G  N     F2
            C  S  P  R  C  R  P  W  P  P  C  A  T  S  T  P  S  V  S  R  S  C  S  R  V  T  P  S  P  M  P  A  T    F3
        1 TCTGCTCTCCAAGATGCCGACCCTGGCCGCCATGTGCTACAAGTACTCCATCGGTCAGCCGTTCATGCAGCCGCGTAACGCCCTCTCCTATGCCGGCAAC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            P  A  H  D  V  W  R  A  D  R  R  V  Q  G  Q  P  H  R  R  T  R  H  G  P  H  L  H  P  A  C  G  P  R    F1
          F  L  H  M  M  F  G  V  P  T  E  E  Y  K  V  N  P  I  V  E  R  A  M  D  R  I  F  T  L  H  A  D  H  E   F2
           S  C  T  *  C  L  A  C  R  P  K  S  T  R  S  T  P  S  S  N  A  P  W  T  A  S  S  P  C  M  R  T  T     F3
      101 TTCCTGCACATGATGTTTGGCGTGCCGACCGAAGAGTACAAGGTCAACCCCATCGTCGAACGCGCCATGGACCGCATCTTCACCCTGCATGCGGACCACG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  E  R  L  H  L  H  R  A  S  G  R  L  L  R  R  Q  P  V  C  L  Y  R  R  G  D  R  L  P  V  G  T  G     F1
            Q  N  A  S  T  S  T  V  R  L  A  G  S  S  G  A  N  P  F  A  C  I  A  A  G  I  A  S  L  W  G  P  A    F2
          S  R  T  P  P  P  P  P  C  V  W  P  A  P  P  A  P  T  R  L  P  V  S  P  R  G  S  P  P  C  G  D  R  P   F3
      201 AGCAGAACGCCTCCACCTCCACCGTGCGTCTGGCCGGCTCCTCCGGCGCCAACCCGTTTGCCTGTATCGCCGCGGGGATCGCCTCCCTGTGGGGACCGGC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  R  R  C  Q  R  S  L  P  Q  D  A  R  G  D  R  L  R  *  S  H  S  R  V  H  R  Q  G  Q  G  Q  E  R  S   F1
           H  G  G  A  N  E  A  C  L  K  M  L  E  E  I  G  S  V  D  R  I  P  E  Y  I  A  K  A  K  D  K  N  D     F2
            T  A  V  P  T  K  P  A  S  R  C  S  R  R  S  A  P  L  I  A  F  P  S  T  S  P  R  P  R  T  R  T  I    F3
      301 CCACGGCGGTGCCAACGAAGCCTGCCTCAAGATGCTCGAGGAGATCGGCTCCGTTGATCGCATTCCCGAGTACATCGCCAAGGCCAAGGACAAGAACGAT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            V  P  S  D  G  L  R  P  P  G  L  Q  E  P  R  P  P  C  H  R  D  A  R  N  L  P  R  G  T  D  R  A  A    F1
          P  F  R  L  M  G  F  G  H  R  V  Y  K  N  H  D  P  R  A  T  V  M  R  E  T  C  H  E  V  L  T  E  L  Q   F2
           R  S  V  *  W  A  S  A  T  G  S  T  R  T  T  T  P  V  P  P  *  C  A  K  P  A  T  R  Y  *  P  S  C     F3
      401 CCGTTCCGTCTGATGGGCTTCGGCCACCGGGTCTACAAGAACCACGACCCCCGTGCCACCGTGATGCGCGAAACCTGCCACGAGGTACTGACCGAGCTGC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           D  Q  G  S  A  A  G  R  G  H  G  A  G  A  H  R  A  L  R  P  L  L  H  R  E  E  A  L  P  E  R  G  L     F1
            I  K  D  P  L  L  D  V  A  M  E  L  E  R  I  A  L  S  D  P  Y  F  I  E  K  K  L  Y  P  N  V  D  F    F2
          R  S  R  I  R  C  W  T  W  P  W  S  W  S  A  S  R  S  P  T  P  T  S  S  R  R  S  S  T  R  T  W  T  S   F3
      501 AGATCAAGGATCCGCTGCTGGACGTGGCCATGGAGCTGGAGCGCATCGCGCTCTCCGACCCCTACTTCATCGAGAAGAAGCTCTACCCGAACGTGGACTT 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          L  L  R  H  H  H  E  G  H  R  H  P  H  V  H  V  H  R  D  L  R  H  L  P  Y  H  R  L  D  C  P  L         F1
           Y  S  G  I  I  M  K  A  I  G  I  P  M  S  M  F  T  V  I  F  A  I  S  R  T  I  G  W  I  A  H  X        F2
            T  P  A  S  S  *  R  P  S  A  S  P  C  P  C  S  P  *  S  S  P  S  P  V  P  S  A  G  L  P  T          F3
      601 CTACTCCGGCATCATCATGAAGGCCATCGGCATCCCCATGTCCATGTTCACCGTGATCTTCGCCATCTCCCGTACCATCGGCTGGATTGCCCACT 695
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